13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2417 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 404 aa  796    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3173  hypothetical protein  41.53 
 
 		 389 aa  184  3e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.09 
 
 		 644 aa  105  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  34.72 
 
 		 642 aa  103  4e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.87 
 
 		 701 aa  101  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4439  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.36 
 
 		 850 aa  95.9  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.46 
 
 		 686 aa  95.1  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1680  hypothetical protein  30.88 
 
 		 314 aa  83.2  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.36 
 
 		 743 aa  81.6  0.00000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6385  peptidase  31.9 
 
 		 952 aa  76.3  0.0000000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.4 
 
 		 669 aa  73.2  0.000000000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  30.72 
 
 		 961 aa  58.2  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4964  hypothetical protein  28.21 
 
 		 382 aa  43.9  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>