67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1397 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002976  SERP1397  glutamyl endopeptidase precursor SspA  100 
 
 
282 aa  572  1.0000000000000001e-162  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1107  glutamyl endopeptidase  50.53 
 
 
342 aa  294  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000076539  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1130  glutamyl endopeptidase  50.53 
 
 
342 aa  294  9e-79  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000101388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1864  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.56 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.825856  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  30.56 
 
 
235 aa  91.7  1e-17  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.8 
 
 
254 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1898  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.8 
 
 
254 aa  84  0.000000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1862  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.58 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1897  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.58 
 
 
239 aa  79.3  0.00000000000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1861  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.31 
 
 
239 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1896  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.31 
 
 
239 aa  77  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2618  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  31.67 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2672  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  31.67 
 
 
358 aa  69.7  0.00000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5547  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.22 
 
 
266 aa  63.9  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014159  Tpau_4335  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.19 
 
 
294 aa  60.8  0.00000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0594008  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1110  S2 family protease  26.29 
 
 
228 aa  58.5  0.0000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1229  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.16 
 
 
298 aa  53.5  0.000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0581563  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3414  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.69 
 
 
363 aa  52.8  0.000007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.204379  normal  0.0483754 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  27.72 
 
 
475 aa  52.4  0.000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1138  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.4 
 
 
288 aa  52.4  0.000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.473362  hitchhiker  0.0000326844 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5027  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.7 
 
 
308 aa  52  0.00001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1393  hypothetical protein  28.63 
 
 
416 aa  51.2  0.00002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.040019  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1248  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.4 
 
 
287 aa  50.8  0.00003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.490271 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28631  hypothetical protein  26.44 
 
 
247 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.89 
 
 
321 aa  49.7  0.00006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07340  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  21.46 
 
 
552 aa  49.7  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.191801 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2005  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
512 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.915591 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3475  V8-like Glu-specific endopeptidase-like protein  23.64 
 
 
305 aa  48.5  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1680  hypothetical protein  27.92 
 
 
314 aa  47.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1619  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.55 
 
 
242 aa  48.1  0.0002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.527174 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0798  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.52 
 
 
296 aa  47  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.408859 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0866  extracellular metalloprotease  25.63 
 
 
322 aa  47  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000104753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0510  Colicin V production protein  22.62 
 
 
399 aa  46.2  0.0006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11247  serine protease htrA  28.74 
 
 
528 aa  45.8  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.039312  hitchhiker  0.00292251 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  26.03 
 
 
348 aa  45.8  0.0009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  28.04 
 
 
515 aa  45.1  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  27.67 
 
 
485 aa  45.4  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2721  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25 
 
 
545 aa  44.3  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.331753  normal  0.316507 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2398  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.21 
 
 
531 aa  44.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.14 
 
 
686 aa  44.3  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  25.7 
 
 
631 aa  44.7  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_3562  predicted protein  27.5 
 
 
329 aa  44.3  0.003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0669  2-alkenal reductase  26.23 
 
 
524 aa  43.9  0.003  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3107  protease Do  27.04 
 
 
504 aa  43.9  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.202807  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2411  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.12 
 
 
366 aa  43.5  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  29.11 
 
 
379 aa  43.1  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3157  hypothetical protein  25.71 
 
 
405 aa  43.5  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.842057  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5430  colicin V production protein  26.34 
 
 
397 aa  43.5  0.004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.658755 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28681  hypothetical protein  27.59 
 
 
539 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.71597 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0860  extracellular metalloprotease protein  24.31 
 
 
323 aa  43.5  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3571  PDZ/DHR/GLGF domain-containing protein  25.42 
 
 
701 aa  43.1  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.226926  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11061  hypothetical protein  27.61 
 
 
341 aa  43.1  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0258  Colicin V production protein  27.33 
 
 
395 aa  43.1  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.73696  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0833  protease DO  24.64 
 
 
497 aa  43.1  0.006  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0653734  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8860  Colicin V production protein  25.11 
 
 
393 aa  42.7  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4522  extracellular metalloprotease  23.75 
 
 
306 aa  43.1  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0902848  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3822  peptidase S1C, Do  25.64 
 
 
501 aa  43.1  0.006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.58 
 
 
644 aa  42.7  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1446  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.42 
 
 
845 aa  43.1  0.006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0617491  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  26.42 
 
 
459 aa  42.7  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28501  hypothetical protein  27.59 
 
 
706 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  22.43 
 
 
677 aa  42.7  0.007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22490  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  25.93 
 
 
247 aa  42.7  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28721  hypothetical protein  27.59 
 
 
706 aa  42.7  0.007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28701  hypothetical protein  27.59 
 
 
582 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0201  chitinase like protein  25.73 
 
 
1204 aa  42.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.137759 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0722  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.58 
 
 
397 aa  42.4  0.01  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>