12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3173 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3173  hypothetical protein  100 
 
 		 389 aa  793    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  41.53 
 
 		 404 aa  180  2.9999999999999997e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4439  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.03 
 
 		 850 aa  112  1.0000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.71 
 
 		 701 aa  105  2e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.58 
 
 		 644 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.78 
 
 		 686 aa  85.1  0.000000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  30.83 
 
 		 642 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6385  peptidase  30.85 
 
 		 952 aa  78.2  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.05 
 
 		 743 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1680  hypothetical protein  27.2 
 
 		 314 aa  76.3  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.17 
 
 		 669 aa  68.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  27.31 
 
 		 961 aa  53.9  0.000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>