48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0799 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  100 
 
 		 669 aa  1340    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.29 
 
 		 644 aa  310  5e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  37.38 
 
 		 642 aa  307  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.53 
 
 		 316 aa  193  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.46 
 
 		 701 aa  186  1.0000000000000001e-45  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.71 
 
 		 314 aa  185  3e-45  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.7 
 
 		 309 aa  173  1e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.45 
 
 		 311 aa  170  6e-41  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  33.24 
 
 		 631 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  41 
 
 		 273 aa  164  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.04 
 
 		 721 aa  163  1e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  40.61 
 
 		 741 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.31 
 
 		 272 aa  154  4e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.91 
 
 		 305 aa  154  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.27 
 
 		 686 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  34.17 
 
 		 337 aa  142  1.9999999999999998e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.85 
 
 		 724 aa  138  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3413  hypothetical protein  34.19 
 
 		 961 aa  130  6e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0649675  normal  0.019371 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.99 
 
 		 720 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1680  hypothetical protein  37.27 
 
 		 314 aa  110  9.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.394553  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.16 
 
 		 743 aa  107  7e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.71 
 
 		 422 aa  101  4e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.18 
 
 		 404 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.61506 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3173  hypothetical protein  29.08 
 
 		 389 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4439  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  31.48 
 
 		 850 aa  74.7  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.071134 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.53 
 
 		 301 aa  71.6  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.53 
 
 		 301 aa  71.2  0.00000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6385  peptidase  29.52 
 
 		 952 aa  64.7  0.000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2420  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.87 
 
 		 802 aa  57.4  0.0000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352257  normal  0.785952 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.87 
 
 		 297 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.25 
 
 		 295 aa  48.5  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.38 
 
 		 632 aa  48.5  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.61 
 
 		 297 aa  48.1  0.0006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  28.74 
 
 		 275 aa  47.8  0.0007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.77 
 
 		 235 aa  47  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.65 
 
 		 321 aa  45.8  0.002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2295  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.86 
 
 		 348 aa  46.2  0.002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000402922  decreased coverage  0.000101093 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2213  DNA/RNA non-specific endonuclease  25 
 
 		 291 aa  46.2  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.718467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.43 
 
 		 277 aa  46.6  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.32 
 
 		 291 aa  45.4  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2047  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  25.32 
 
 		 302 aa  45.1  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000019362  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.09 
 
 		 309 aa  44.7  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0108  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.62 
 
 		 420 aa  44.7  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.94824  normal  0.647846 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2350  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.32 
 
 		 302 aa  44.7  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000288623  hitchhiker  0.00789181 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2565  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.42 
 
 		 267 aa  44.7  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000966984  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1871  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.29 
 
 		 263 aa  44.3  0.008  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00000105859  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3644  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.63 
 
 		 279 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000556838  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2256  peptidase S1C, Do  26.4 
 
 		 498 aa  43.9  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.213133  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>