57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_5484 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  100 
 
 		 741 aa  1506    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  35.53 
 
 		 631 aa  394  1e-108  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.58 
 
 		 720 aa  276  1.0000000000000001e-72  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.91 
 
 		 724 aa  273  8.000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  50.94 
 
 		 721 aa  265  2e-69  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  47.79 
 
 		 694 aa  216  9e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  43.65 
 
 		 677 aa  207  5e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.75 
 
 		 316 aa  201  5e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.71 
 
 		 314 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  40.62 
 
 		 401 aa  193  1e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  45.05 
 
 		 311 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.64 
 
 		 309 aa  181  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.22 
 
 		 686 aa  178  3e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.06 
 
 		 273 aa  169  2e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.34 
 
 		 669 aa  167  5e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.09 
 
 		 644 aa  167  5.9999999999999996e-40  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  37.09 
 
 		 642 aa  165  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.07 
 
 		 272 aa  160  9e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.68 
 
 		 305 aa  155  4e-36  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.54 
 
 		 701 aa  154  5e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.04 
 
 		 743 aa  152  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.05 
 
 		 337 aa  110  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  35.29 
 
 		 348 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.05 
 
 		 301 aa  97.8  6e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.05 
 
 		 301 aa  97.4  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.4 
 
 		 422 aa  92.4  3e-17  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  30.63 
 
 		 369 aa  88.2  5e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  32.37 
 
 		 363 aa  79.7  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  29.55 
 
 		 572 aa  78.6  0.0000000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  24.91 
 
 		 356 aa  66.2  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  32.31 
 
 		 363 aa  64.7  0.000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  22.73 
 
 		 274 aa  55.8  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  27.81 
 
 		 482 aa  53.9  0.00001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0023  PKD repeat-containing protein  29.74 
 
 		 385 aa  53.5  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0571  hypothetical protein  43.75 
 
 		 564 aa  51.2  0.00007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  29.14 
 
 		 476 aa  50.8  0.00008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2420  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.67 
 
 		 802 aa  50.1  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352257  normal  0.785952 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1937  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.88 
 
 		 297 aa  48.5  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  decreased coverage  0.0092281  normal  0.635085 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22490  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  29.17 
 
 		 247 aa  47.8  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2452  PDZ/DHR/GLGF domain protein  27.22 
 
 		 358 aa  47.8  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.767281  normal  0.478055 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  22.64 
 
 		 356 aa  47  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.88 
 
 		 295 aa  47.4  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.4 
 
 		 632 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.59 
 
 		 277 aa  46.6  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1200  hypothetical protein  27.54 
 
 		 491 aa  45.8  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  30 
 
 		 458 aa  45.4  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  31.68 
 
 		 457 aa  45.4  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1896  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.38 
 
 		 239 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1861  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.38 
 
 		 239 aa  45.1  0.004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  26.54 
 
 		 501 aa  45.1  0.005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2295  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.43 
 
 		 348 aa  45.1  0.005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000402922  decreased coverage  0.000101093 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2350  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.7 
 
 		 302 aa  45.1  0.006  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000288623  hitchhiker  0.00789181 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2047  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  26.7 
 
 		 302 aa  44.7  0.006  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000019362  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.15 
 
 		 304 aa  44.3  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.29 
 
 		 298 aa  44.7  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.97 
 
 		 309 aa  44.3  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3160  PKD repeat-containing protein  27.61 
 
 		 396 aa  44.3  0.009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843652  hitchhiker  0.0000187562 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>