65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2516 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  810    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  41.25 
 
 		 694 aa  203  5e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  42.57 
 
 		 631 aa  197  2.0000000000000003e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  44 
 
 		 741 aa  192  8e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  45.86 
 
 		 677 aa  189  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.93 
 
 		 721 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  42.48 
 
 		 720 aa  142  8e-33  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  35.55 
 
 		 724 aa  134  3e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  30.84 
 
 		 348 aa  93.2  7e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  30.99 
 
 		 572 aa  92  2e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  33.49 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  32.98 
 
 		 356 aa  82.8  0.00000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  33.63 
 
 		 363 aa  80.1  0.00000000000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  28.77 
 
 		 369 aa  79.3  0.0000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  25.1 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  30.62 
 
 		 476 aa  63.2  0.000000008  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0023  PKD repeat-containing protein  31.15 
 
 		 385 aa  61.6  0.00000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  30.1 
 
 		 482 aa  60.1  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3032  hypothetical protein  32.3 
 
 		 328 aa  59.3  0.0000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  0.0112295 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0726  hypothetical protein  32.13 
 
 		 338 aa  55.5  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  27.54 
 
 		 405 aa  54.3  0.000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1130  glutamyl endopeptidase  29.79 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000101388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1107  glutamyl endopeptidase  29.79 
 
 		 342 aa  53.1  0.000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000076539  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3160  PKD repeat-containing protein  28.43 
 
 		 396 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843652  hitchhiker  0.0000187562 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0571  hypothetical protein  35.64 
 
 		 564 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.74 
 
 		 254 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1898  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.74 
 
 		 254 aa  51.6  0.00003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  25.79 
 
 		 418 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  26.04 
 
 		 480 aa  48.9  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3598  2-alkenal reductase  27.13 
 
 		 397 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.857823  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01011  serine protease  26.6 
 
 		 380 aa  47.4  0.0005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.336111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  26.95 
 
 		 475 aa  47  0.0006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3517  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.75 
 
 		 404 aa  46.6  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2158  2-alkenal reductase  27.6 
 
 		 368 aa  46.6  0.0008  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3174  hypothetical protein  25.7 
 
 		 633 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4964  hypothetical protein  26.86 
 
 		 382 aa  45.8  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  25.44 
 
 		 499 aa  46.2  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  26.43 
 
 		 523 aa  46.2  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  29.56 
 
 		 474 aa  45.8  0.001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1651  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.13 
 
 		 321 aa  46.2  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000137982  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0715  protease Do  27.22 
 
 		 500 aa  45.8  0.001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00445387  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  25.29 
 
 		 493 aa  45.1  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0585  PDZ/DHR/GLGF  28.32 
 
 		 406 aa  45.4  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  hitchhiker  0.0000000357237  normal  0.0103671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0739  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  29.19 
 
 		 371 aa  45.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0922  protease Do family protein  25.86 
 
 		 496 aa  45.1  0.002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.726985  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  27.27 
 
 		 411 aa  45.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  25.29 
 
 		 506 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0736  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  24.39 
 
 		 386 aa  44.3  0.003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.00000000182436  normal  0.877655 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  29.59 
 
 		 497 aa  45.1  0.003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4416  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.52 
 
 		 410 aa  44.3  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.464298  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1880  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.92 
 
 		 386 aa  44.7  0.003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0947444  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  25.29 
 
 		 493 aa  44.3  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0758  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.31 
 
 		 375 aa  44.3  0.004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0147516  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2659  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.81 
 
 		 565 aa  43.9  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.144865 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00650  2-alkenal reductase  27.6 
 
 		 400 aa  43.9  0.005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.5 
 
 		 686 aa  43.9  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1098  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  28.12 
 
 		 245 aa  43.9  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.21329  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  25.88 
 
 		 501 aa  43.9  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  24.87 
 
 		 379 aa  43.9  0.006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1859  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.56 
 
 		 544 aa  43.5  0.007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.308507  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  25.71 
 
 		 485 aa  43.1  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  26.32 
 
 		 379 aa  43.1  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  26.4 
 
 		 462 aa  43.1  0.008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0211  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.5 
 
 		 269 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.4948  normal  0.583345 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1467  peptidase S1C, Do  24.37 
 
 		 499 aa  43.1  0.01  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.441743  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>