54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5196 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  100 
 
 		 694 aa  1389    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  44.98 
 
 		 677 aa  504  1e-141  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  47.79 
 
 		 741 aa  214  2.9999999999999995e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  41.25 
 
 		 401 aa  202  1.9999999999999998e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  47.13 
 
 		 631 aa  201  3e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.36 
 
 		 721 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.99 
 
 		 724 aa  149  1.0000000000000001e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.75 
 
 		 720 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  34.58 
 
 		 348 aa  105  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  30.04 
 
 		 572 aa  85.9  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  34.45 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4089  V8-like Glu-specific endopeptidase  30.84 
 
 		 296 aa  84.3  0.000000000000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  32.38 
 
 		 363 aa  76.6  0.000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0593  hypothetical protein  25.16 
 
 		 294 aa  72.8  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3750  serine protease  26.85 
 
 		 315 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  28.16 
 
 		 356 aa  61.6  0.00000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3724  hypothetical protein  37.93 
 
 		 290 aa  59.3  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3032  hypothetical protein  32.98 
 
 		 328 aa  58.5  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  0.0112295 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0981  hypothetical protein  28.42 
 
 		 319 aa  57.8  0.0000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  28.91 
 
 		 363 aa  56.2  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3643  hypothetical protein  29.71 
 
 		 291 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.370129 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0945  hypothetical protein  27.89 
 
 		 319 aa  54.7  0.000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.830794 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  24.75 
 
 		 356 aa  53.9  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0726  hypothetical protein  30.98 
 
 		 338 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0571  hypothetical protein  33.04 
 
 		 564 aa  52.4  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0921  hypothetical protein  28.35 
 
 		 319 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.906355 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3226  2-alkenal reductase  31.18 
 
 		 403 aa  50.8  0.00009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  26.32 
 
 		 515 aa  50.1  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  26.67 
 
 		 457 aa  49.7  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  27.27 
 
 		 475 aa  49.7  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3225  hypothetical protein  31.02 
 
 		 277 aa  48.9  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1130  glutamyl endopeptidase  26.9 
 
 		 342 aa  48.9  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000101388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1107  glutamyl endopeptidase  26.9 
 
 		 342 aa  48.9  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000076539  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3597  hypothetical protein  27.85 
 
 		 273 aa  48.1  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.713823 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01407  serine peptidase  31.94 
 
 		 604 aa  48.1  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210729  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  26.06 
 
 		 458 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3160  PKD repeat-containing protein  28.03 
 
 		 396 aa  46.6  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843652  hitchhiker  0.0000187562 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0154  hypothetical protein  34.33 
 
 		 312 aa  47  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1058  hypothetical protein  43.94 
 
 		 290 aa  46.2  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4964  hypothetical protein  29.25 
 
 		 382 aa  46.2  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6920  hypothetical protein  42.03 
 
 		 256 aa  46.2  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000215258  hitchhiker  0.000122143 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  28.05 
 
 		 499 aa  45.4  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  27.33 
 
 		 462 aa  45.8  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  25 
 
 		 464 aa  45.8  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  28.48 
 
 		 472 aa  45.8  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4520  hypothetical protein  27.06 
 
 		 448 aa  45.1  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  27.95 
 
 		 498 aa  45.1  0.004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2221  HtrA2 peptidase  27.16 
 
 		 372 aa  45.1  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0662653  normal  0.181981 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0763  protease Do  26.51 
 
 		 501 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0210  serine protease  29.63 
 
 		 497 aa  45.1  0.005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187881  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  28.78 
 
 		 476 aa  44.7  0.006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1611  protease Do  26.06 
 
 		 482 aa  44.7  0.007  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.4051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  27.98 
 
 		 480 aa  44.3  0.008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  28.32 
 
 		 488 aa  43.9  0.009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>