54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_2816 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  100 
 
 		 348 aa  715    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  34.35 
 
 		 631 aa  113  5e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.58 
 
 		 721 aa  111  2.0000000000000002e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  35.29 
 
 		 741 aa  108  2e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  32.58 
 
 		 677 aa  106  6e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  34.58 
 
 		 694 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  30.84 
 
 		 401 aa  93.6  5e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  34 
 
 		 720 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  33.33 
 
 		 369 aa  85.9  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0023  PKD repeat-containing protein  28.44 
 
 		 385 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  28.38 
 
 		 356 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  27.99 
 
 		 356 aa  76.6  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3160  PKD repeat-containing protein  28.19 
 
 		 396 aa  73.2  0.000000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843652  hitchhiker  0.0000187562 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.45 
 
 		 724 aa  68.9  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  29.95 
 
 		 363 aa  68.9  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  28.5 
 
 		 572 aa  65.5  0.000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  28.05 
 
 		 476 aa  63.9  0.000000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  26.58 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  27.91 
 
 		 482 aa  55.8  0.0000009  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0726  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1200  hypothetical protein  27.22 
 
 		 491 aa  53.9  0.000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3032  hypothetical protein  25 
 
 		 328 aa  53.5  0.000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  0.0112295 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  27.38 
 
 		 499 aa  51.6  0.00002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  27.22 
 
 		 473 aa  50.4  0.00004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6094  putative Serine protease do-like precursor  28.49 
 
 		 498 aa  49.7  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  27.98 
 
 		 520 aa  48.9  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  25.13 
 
 		 501 aa  48.9  0.0001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  26.67 
 
 		 515 aa  48.1  0.0002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2041  peptidase S1C, Do  27.17 
 
 		 498 aa  47.8  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4529  protease Do  26.63 
 
 		 516 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.366084 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  25.75 
 
 		 480 aa  47  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1999  protease Do  26.95 
 
 		 506 aa  46.6  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0697759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3349  peptidase S1C, Do  26.59 
 
 		 499 aa  46.2  0.0008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.181903 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0355  serine protease  26.95 
 
 		 493 aa  46.2  0.0008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.459558  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  26.32 
 
 		 527 aa  45.4  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0704  protease Do  26.47 
 
 		 500 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.762947  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3259  peptidase S1C, Do  27.17 
 
 		 497 aa  45.1  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.324344  normal  0.259222 
 
 
-
 
NC_004310  BR1394  serine protease Do, putative  27.06 
 
 		 524 aa  44.7  0.003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2812  serine protease  26.79 
 
 		 528 aa  44.7  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.498431  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2883  protease Do  27.22 
 
 		 511 aa  44.3  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4002  protease Do  26.59 
 
 		 501 aa  44.3  0.003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0664  hypothetical protein  30.39 
 
 		 3965 aa  44.3  0.003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.59354 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2656  protease Do  27.22 
 
 		 511 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.419635 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  30.23 
 
 		 498 aa  44.3  0.003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0637  protease Do  27.95 
 
 		 517 aa  44.3  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.136267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1350  putative serine protease Do  27.06 
 
 		 524 aa  44.7  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2778  protease Do  26.63 
 
 		 511 aa  43.9  0.004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.725165  normal  0.242961 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  26.63 
 
 		 464 aa  43.9  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  28.31 
 
 		 505 aa  44.3  0.004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2725  peptidase S1C, Do  26.74 
 
 		 497 aa  43.9  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1746  protease Do  26.74 
 
 		 471 aa  43.5  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1797  protease Do  26.47 
 
 		 520 aa  43.1  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0571  hypothetical protein  52.38 
 
 		 564 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  26.67 
 
 		 493 aa  43.1  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>