19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tery_4310 on replicon NC_008312
Organism: Trichodesmium erythraeum IMS101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  734    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  26.16 
 
 		 363 aa  91.3  2e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  28.33 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.14 
 
 		 724 aa  70.5  0.00000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  25.52 
 
 		 401 aa  69.7  0.00000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4308  hypothetical protein  40.21 
 
 		 570 aa  69.7  0.00000000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0225871  normal  0.274064 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  27.97 
 
 		 356 aa  66.6  0.0000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  28.45 
 
 		 631 aa  66.2  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.57 
 
 		 720 aa  64.7  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4964  hypothetical protein  24.75 
 
 		 382 aa  65.1  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  26.34 
 
 		 363 aa  62.8  0.000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.1 
 
 		 721 aa  60.5  0.00000004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  27.97 
 
 		 572 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  25.37 
 
 		 694 aa  57  0.0000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  23.11 
 
 		 741 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  25 
 
 		 677 aa  53.5  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  22.41 
 
 		 369 aa  50.1  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3174  hypothetical protein  23.87 
 
 		 633 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0325  hypothetical protein  28.1 
 
 		 491 aa  44.7  0.002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>