26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_2418 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  100 
 
 		 363 aa  716    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  44.85 
 
 		 363 aa  267  2e-70  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4964  hypothetical protein  32.52 
 
 		 382 aa  97.1  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  33.48 
 
 		 401 aa  84.3  0.000000000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  31.12 
 
 		 631 aa  82.4  0.00000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  31.22 
 
 		 741 aa  82  0.00000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  32.38 
 
 		 694 aa  79.7  0.00000000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2419  hypothetical protein  45.63 
 
 		 431 aa  79  0.0000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.783894  normal  0.656965 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.89 
 
 		 720 aa  77.8  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  31.31 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4438  hypothetical protein  30.35 
 
 		 601 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.13249 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.61 
 
 		 724 aa  73.2  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3174  hypothetical protein  28.8 
 
 		 633 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.87 
 
 		 721 aa  71.2  0.00000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  29.94 
 
 		 677 aa  64.7  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  27.14 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  26.6 
 
 		 356 aa  60.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  26.47 
 
 		 476 aa  55.1  0.000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  29.17 
 
 		 369 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  27.91 
 
 		 482 aa  53.9  0.000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0023  PKD repeat-containing protein  27.23 
 
 		 385 aa  53.1  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0726  hypothetical protein  28.57 
 
 		 338 aa  51.2  0.00003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3032  hypothetical protein  29 
 
 		 328 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  0.0112295 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0571  hypothetical protein  28.25 
 
 		 564 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3160  PKD repeat-containing protein  26.78 
 
 		 396 aa  47  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843652  hitchhiker  0.0000187562 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  29.59 
 
 		 572 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>