14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_4964 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_4964  hypothetical protein  100 
 
 		 382 aa  772    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  33.19 
 
 		 363 aa  90.1  6e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  34.32 
 
 		 363 aa  88.6  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4438  hypothetical protein  26.19 
 
 		 601 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.13249 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3174  hypothetical protein  30.47 
 
 		 633 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  28.74 
 
 		 631 aa  63.2  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  24.49 
 
 		 356 aa  60.1  0.00000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.26 
 
 		 724 aa  53.1  0.000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  27.94 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  27.4 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  26.75 
 
 		 401 aa  45.8  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  29.25 
 
 		 694 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  28.27 
 
 		 677 aa  44.7  0.003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2417  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.21 
 
 		 404 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.429127  normal  0.61506 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>