100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0899 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  100 
 
 		 677 aa  1337    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  44.59 
 
 		 694 aa  510  1e-143  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  36.58 
 
 		 741 aa  209  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.32 
 
 		 721 aa  194  4e-48  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  40.62 
 
 		 401 aa  191  2.9999999999999997e-47  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  37.46 
 
 		 631 aa  188  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  39.42 
 
 		 720 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.39 
 
 		 724 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4089  V8-like Glu-specific endopeptidase  35.06 
 
 		 296 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.355877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  32.58 
 
 		 348 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  35.63 
 
 		 369 aa  95.1  4e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0981  hypothetical protein  31.1 
 
 		 319 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.411315 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3724  hypothetical protein  27.69 
 
 		 290 aa  76.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.175481  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0945  hypothetical protein  31.1 
 
 		 319 aa  76.3  0.000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.790571  normal  0.830794 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0921  hypothetical protein  31.71 
 
 		 319 aa  75.1  0.000000000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.906355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3597  hypothetical protein  32.95 
 
 		 273 aa  69.3  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.713823 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  27.73 
 
 		 572 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0593  hypothetical protein  23.49 
 
 		 294 aa  68.9  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.100868  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  28.42 
 
 		 356 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  29.94 
 
 		 363 aa  66.6  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  28.04 
 
 		 363 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  28.49 
 
 		 462 aa  55.8  0.000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3225  hypothetical protein  34.33 
 
 		 277 aa  55.5  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  26.16 
 
 		 464 aa  55.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3643  hypothetical protein  32.94 
 
 		 291 aa  55.1  0.000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.370129 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0726  hypothetical protein  29.9 
 
 		 338 aa  53.9  0.000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.62736  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1107  glutamyl endopeptidase  24.71 
 
 		 342 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000076539  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3750  serine protease  35.29 
 
 		 315 aa  53.1  0.00001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2956  protease Do  28.74 
 
 		 472 aa  53.5  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000460419  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1208  protease Do  29.78 
 
 		 475 aa  53.1  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0118678  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1130  glutamyl endopeptidase  24.71 
 
 		 342 aa  53.5  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000101388  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0331  trypsin domain/PDZ domain-containing protein  24.18 
 
 		 464 aa  53.1  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00109847  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0128  protease Do  29.76 
 
 		 474 aa  52.8  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.445461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0154  hypothetical protein  30.56 
 
 		 312 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3032  hypothetical protein  28.79 
 
 		 328 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.788507  normal  0.0112295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6920  hypothetical protein  30.92 
 
 		 256 aa  52  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.0000215258  hitchhiker  0.000122143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1058  hypothetical protein  27.96 
 
 		 290 aa  52.4  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.971814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0571  hypothetical protein  34.23 
 
 		 564 aa  51.6  0.00005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0228  protease Do  26.51 
 
 		 457 aa  51.2  0.00007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  24.57 
 
 		 466 aa  50.4  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0244  protease Do  25.9 
 
 		 458 aa  49.7  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0117444  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0147  serine protease  29.27 
 
 		 485 aa  49.7  0.0002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000224788 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0802  peptidase S1, chymotrypsin  28.24 
 
 		 379 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02108  protease signal peptide protein  29.09 
 
 		 490 aa  48.9  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1602  hypothetical protein  28.43 
 
 		 334 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000664087 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4520  hypothetical protein  26.64 
 
 		 448 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0157  peptidase S1C, Do  28.66 
 
 		 485 aa  48.5  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0747  2-alkenal reductase  28.14 
 
 		 385 aa  48.5  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0721582  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2200  serine protease  23.59 
 
 		 442 aa  48.5  0.0004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.550757  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.29 
 
 		 254 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2013  peptidase S1C, Do  26.32 
 
 		 480 aa  48.1  0.0005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000140166  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1898  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.29 
 
 		 254 aa  48.1  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1784  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  27.07 
 
 		 273 aa  48.1  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.718326  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1773  protease Do  28.05 
 
 		 489 aa  48.1  0.0005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000225032  hitchhiker  0.000850393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2005  protease Do  27.16 
 
 		 475 aa  48.1  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0984  protease Do  31.29 
 
 		 485 aa  47.4  0.0008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  24.5 
 
 		 356 aa  47.4  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8413  Trypsin-like protein serine protease typically periplasmic containing C-terminal PDZ domain-like protein  25.37 
 
 		 527 aa  46.6  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.595687  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2667  protease Do  29.01 
 
 		 520 aa  47.4  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1861  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  22.36 
 
 		 239 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5561  peptidase S1C, Do  27.78 
 
 		 488 aa  47  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1896  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.36 
 
 		 239 aa  47.4  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2494  serine protease  23.35 
 
 		 459 aa  47  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  23.46 
 
 		 264 aa  45.8  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0484  2-alkenal reductase  23.43 
 
 		 388 aa  45.8  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000148342  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2442  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  28.33 
 
 		 259 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  0.000823282  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3170  peptidase S1C, Do  30.12 
 
 		 515 aa  46.2  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.963921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1661  protease Do  28.14 
 
 		 498 aa  46.2  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.179012 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1805  S1A family peptidase  26.52 
 
 		 273 aa  46.2  0.002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  23.87 
 
 		 235 aa  45.8  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0934  trypsin domain protein  26.97 
 
 		 382 aa  45.8  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1864  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  23.87 
 
 		 235 aa  45.8  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.825856  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  28.16 
 
 		 772 aa  45.4  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4323  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.28 
 
 		 405 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0887  protease Do  28.31 
 
 		 493 aa  45.1  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0626906  normal  0.172287 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1008  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.06 
 
 		 487 aa  45.1  0.004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_12621  hypothetical protein  28 
 
 		 459 aa  45.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01407  serine peptidase  31.78 
 
 		 604 aa  45.1  0.004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.210729  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4861  protease Do  26.51 
 
 		 492 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.837631 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1382  protease Do  26.83 
 
 		 514 aa  45.1  0.005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.490263  normal  0.542535 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3784  protease Do  26.51 
 
 		 492 aa  45.1  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2759  hypothetical protein  29.94 
 
 		 331 aa  44.7  0.005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.645738  hitchhiker  0.00620663 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1200  hypothetical protein  28.66 
 
 		 491 aa  45.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0111  2-alkenal reductase  26.59 
 
 		 348 aa  44.7  0.005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.153202 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1914  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  26.52 
 
 		 273 aa  44.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3620  multifunctional serine-type endopeptidase /oxidoreductase  26.99 
 
 		 487 aa  44.7  0.006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2733  protease do precursor  27.49 
 
 		 501 aa  44.7  0.006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0138399  normal  0.054673 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0434  protease Do family protein  29.27 
 
 		 505 aa  44.3  0.007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0166  periplasmic serine protease  26.42 
 
 		 473 aa  44.3  0.007  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.358427  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1378  HtrA2 peptidase  26.04 
 
 		 379 aa  44.3  0.007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000042799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4964  hypothetical protein  28.27 
 
 		 382 aa  44.3  0.008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  29.09 
 
 		 499 aa  44.3  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1601  S1A family peptidase  26.52 
 
 		 273 aa  43.9  0.009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2046  protease Do  29.17 
 
 		 525 aa  43.9  0.009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.858833  normal  0.0343309 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01557  hypothetical protein  26.52 
 
 		 273 aa  43.9  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2308  peptidase, S1A (chymotrypsin) family  26.52 
 
 		 273 aa  43.9  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.740577 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01567  predicted peptidase  26.52 
 
 		 273 aa  43.9  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1672  S1A family peptidase  26.52 
 
 		 273 aa  43.9  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2032  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.52 
 
 		 273 aa  43.9  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.867836 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2045  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  26.52 
 
 		 273 aa  43.9  0.01  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.766167  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>