15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lcho_0571 on replicon NC_010524
Organism: Leptothrix cholodnii SP-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010524  Lcho_0571  hypothetical protein  100 
 
 		 564 aa  1123    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  33.09 
 
 		 572 aa  244  3e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  27.69 
 
 		 401 aa  63.9  0.000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.75 
 
 		 720 aa  62  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  26.37 
 
 		 631 aa  60.5  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  32.55 
 
 		 721 aa  58.9  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  25.99 
 
 		 356 aa  58.2  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  27.11 
 
 		 694 aa  54.7  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  29.41 
 
 		 677 aa  52.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  29.29 
 
 		 741 aa  52.4  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  35.26 
 
 		 797 aa  50.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  27.31 
 
 		 369 aa  50.8  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  29.91 
 
 		 363 aa  47.8  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.06 
 
 		 724 aa  47.8  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  27.73 
 
 		 348 aa  43.5  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>