90 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2975 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  100 
 
 		 631 aa  1307    Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  38.49 
 
 		 721 aa  389  1e-106  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  30.99 
 
 		 724 aa  253  8.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2239  DNA/RNA non-specific endonuclease  49.58 
 
 		 314 aa  228  3e-58  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.838168 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2474  DNA/RNA non-specific endonuclease  47.76 
 
 		 316 aa  226  8e-58  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.169636  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4436  DNA/RNA non-specific endonuclease  44.4 
 
 		 311 aa  214  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  39.3 
 
 		 741 aa  203  9e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  47.13 
 
 		 694 aa  201  3e-50  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47090  putative protease  31.48 
 
 		 642 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  42.57 
 
 		 401 aa  197  6e-49  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3250  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.4 
 
 		 686 aa  191  2.9999999999999997e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4063  DNA/RNA non-specific endonuclease  40.41 
 
 		 644 aa  191  4e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  41.8 
 
 		 677 aa  182  1e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3176  DNA/RNA non-specific endonuclease  41.77 
 
 		 309 aa  179  1e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0770  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.82 
 
 		 273 aa  171  5e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.827563  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1035  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.95 
 
 		 305 aa  166  1.0000000000000001e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.969234  normal  0.342127 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0799  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.24 
 
 		 669 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0949  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.63 
 
 		 337 aa  161  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0787893  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2957  DNA/RNA non-specific endonuclease  37.24 
 
 		 272 aa  155  2.9999999999999998e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0924  DNA/RNA non-specific endonuclease  34 
 
 		 422 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  36.02 
 
 		 720 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3581  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.89 
 
 		 701 aa  134  5e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.410045  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  34.35 
 
 		 348 aa  113  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2812  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.96 
 
 		 301 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.750858  normal  0.309209 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2530  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.27 
 
 		 743 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3304  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.57 
 
 		 301 aa  112  3e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  31.84 
 
 		 356 aa  81.6  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  28.25 
 
 		 369 aa  75.9  0.000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  31.12 
 
 		 363 aa  75.5  0.000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  28.7 
 
 		 572 aa  70.9  0.00000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  31.62 
 
 		 363 aa  70.5  0.00000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0023  PKD repeat-containing protein  31.95 
 
 		 385 aa  65.1  0.000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4964  hypothetical protein  28.74 
 
 		 382 aa  63.2  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  28.02 
 
 		 356 aa  62.8  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0413  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.43 
 
 		 293 aa  60.8  0.00000007  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.934421  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5192  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.7 
 
 		 235 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4899  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.32 
 
 		 265 aa  57.8  0.0000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.835138  normal  0.203553 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7139  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.62 
 
 		 309 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.771886  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0573  endonuclease  23.93 
 
 		 256 aa  57  0.0000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0414  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.93 
 
 		 277 aa  56.6  0.000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2129  DNA/RNA non-specific endonuclease  22.12 
 
 		 283 aa  56.2  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000700063 
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4799  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.22 
 
 		 359 aa  55.5  0.000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.313673 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6354  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.77 
 
 		 295 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.18 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0336  DNA/RNA non-specific endonuclease  22.61 
 
 		 274 aa  54.7  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.000000000503068  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0792  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.41 
 
 		 356 aa  54.7  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.275213 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2420  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.51 
 
 		 802 aa  54.3  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.352257  normal  0.785952 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1828  DNA/RNA non-specific endonuclease  22.81 
 
 		 291 aa  54.3  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2350  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.87 
 
 		 302 aa  53.9  0.000008  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000288623  hitchhiker  0.00789181 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2726  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.75 
 
 		 269 aa  53.1  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.564947  normal  0.0294848 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4118  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.44 
 
 		 249 aa  53.5  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2047  DNA/RNA non-specific endonuclease (Mg-dependent)  25.87 
 
 		 302 aa  53.9  0.00001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  unclonable  0.000000000000019362  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3160  PKD repeat-containing protein  28.49 
 
 		 396 aa  53.1  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.843652  hitchhiker  0.0000187562 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0885  DNA/RNA non-specific endonuclease  28.95 
 
 		 283 aa  52.8  0.00002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.167923  n/a   
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6268  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.04 
 
 		 304 aa  52  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1810  nuclease  26.67 
 
 		 265 aa  51.6  0.00004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000251579  unclonable  0.0000000338586 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5224  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.56 
 
 		 305 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.270362 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7050  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.58 
 
 		 211 aa  51.6  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.108993 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1560  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.56 
 
 		 305 aa  51.2  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.450692  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3398  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.18 
 
 		 248 aa  51.2  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.736844  normal  0.232626 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2053  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.49 
 
 		 321 aa  49.7  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2089  DNA/RNA non-specific endonuclease  21.36 
 
 		 283 aa  48.9  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4634  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.49 
 
 		 297 aa  48.5  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0693957  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2295  DNA/RNA non-specific endonuclease  25.48 
 
 		 348 aa  48.5  0.0004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000402922  decreased coverage  0.000101093 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1943  2-alkenal reductase  26.19 
 
 		 418 aa  48.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.768183 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1200  hypothetical protein  30.67 
 
 		 491 aa  48.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02448  protease  29.89 
 
 		 482 aa  48.1  0.0005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0571  hypothetical protein  27.97 
 
 		 564 aa  47.8  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3083  trypsin-like serine protease  24.12 
 
 		 462 aa  47.8  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1431  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.83 
 
 		 265 aa  47.8  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0422  hypothetical protein  28.8 
 
 		 476 aa  47.8  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0260128  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2014  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.9 
 
 		 284 aa  47.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.000025013  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1841  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.9 
 
 		 284 aa  47.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.00000000000036697  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1427  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.9 
 
 		 284 aa  47.4  0.0009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000987613  decreased coverage  0.000225479 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1899  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  22.02 
 
 		 235 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0364  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.22 
 
 		 341 aa  46.6  0.001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.761571 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1459  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.9 
 
 		 284 aa  47  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000101242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1864  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  22.02 
 
 		 235 aa  46.6  0.001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.825856  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1953  peptidase S1C, Do  26.63 
 
 		 499 aa  46.2  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.100212  normal  0.0596559 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1898  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  25.68 
 
 		 254 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_79520  Mitochondrial nuclease  23.7 
 
 		 325 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.553306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1863  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  25.68 
 
 		 254 aa  46.2  0.002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1443  DNA/RNA non-specific endonuclease  23.74 
 
 		 388 aa  45.1  0.004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000963372  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3924  DNA/RNA non-specific endonuclease  29.01 
 
 		 342 aa  45.1  0.005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.204737  hitchhiker  0.000259019 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1397  glutamyl endopeptidase precursor SspA  25.7 
 
 		 282 aa  44.7  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0744  putative DNA/RNA non-specific endonuclease protein  24.06 
 
 		 275 aa  44.7  0.006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02818  DNA/RNA non-specific endonuclease  27.68 
 
 		 232 aa  44.3  0.007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1107  glutamyl endopeptidase  24.16 
 
 		 342 aa  43.9  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000076539  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1130  glutamyl endopeptidase  24.16 
 
 		 342 aa  43.9  0.008  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000101388  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0081  DNA/RNA non-specific endonuclease  26.8 
 
 		 298 aa  43.9  0.009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2539  protease Do  26.83 
 
 		 578 aa  43.9  0.01  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.874075 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>