23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3473 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3473  hypothetical protein  100 
 
 		 356 aa  736    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.145252  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1093  DNA/RNA non-specific endonuclease  33.65 
 
 		 720 aa  83.2  0.000000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2516  hypothetical protein  32.98 
 
 		 401 aa  83.2  0.000000000000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15116  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2975  hypothetical protein  31.84 
 
 		 631 aa  81.6  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0264248  normal  0.578454 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2816  serine protease  28.38 
 
 		 348 aa  78.6  0.0000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114661  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3556  hypothetical protein  32.52 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0917866  normal  0.0496884 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2291  DNA/RNA non-specific endonuclease  31.19 
 
 		 721 aa  72.8  0.000000000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.391468  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0899  V8-like Glu-specific endopeptidase  28.42 
 
 		 677 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2531  hypothetical protein  26.02 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5484  hypothetical protein  24.91 
 
 		 741 aa  66.2  0.0000000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2418  hypothetical protein  27.14 
 
 		 363 aa  65.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.435913 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3749  hypothetical protein  30 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5196  V8-like protein Glu-specific endopeptidase-like protein  28.16 
 
 		 694 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.710887  normal  0.178037 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4310  hypothetical protein  27.54 
 
 		 356 aa  58.9  0.0000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.23754  normal  0.426365 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2087  DNA/RNA non-specific endonuclease  24.5 
 
 		 724 aa  56.2  0.0000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.29894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3174  hypothetical protein  26.67 
 
 		 633 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0023  PKD repeat-containing protein  38.82 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.347453  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4964  hypothetical protein  27.4 
 
 		 382 aa  47.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1130  glutamyl endopeptidase  27.78 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000101388  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1107  glutamyl endopeptidase  27.78 
 
 		 342 aa  47.4  0.0004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000076539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0571  hypothetical protein  25.11 
 
 		 564 aa  46.6  0.0006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5428  protease Do  27.74 
 
 		 508 aa  44.7  0.002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.025142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1098  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  27.56 
 
 		 245 aa  44.3  0.004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.21329  normal  0.956497 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>