More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jden_1098 on replicon NC_013174
Organism: Jonesia denitrificans DSM 20603



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_1098  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  100 
 
 		 245 aa  495  1e-139  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.21329  normal  0.956497 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22490  trypsin-like serine protease with C-terminal PDZ domain  53.88 
 
 		 247 aa  260  2e-68  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1313  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  49.14 
 
 		 264 aa  221  7e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1619  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  54.74 
 
 		 242 aa  211  7e-54  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.527174 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0724  putative protease do  31.52 
 
 		 464 aa  76.3  0.0000000000004  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.300996  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1158  DegP2 peptidase  32.04 
 
 		 384 aa  74.7  0.000000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0614  2-alkenal reductase  32.04 
 
 		 383 aa  74.7  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.46298 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1070  2-alkenal reductase  31.11 
 
 		 393 aa  73.9  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000016371  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2308  2-alkenal reductase  32.04 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3420  DegP2 peptidase  31.49 
 
 		 383 aa  74.3  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1769  protease Do  36.05 
 
 		 485 aa  73.9  0.000000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.382566  normal  0.253499 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3387  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.04 
 
 		 384 aa  74.3  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.848439  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0187  2-alkenal reductase  31.15 
 
 		 375 aa  73.6  0.000000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.775579  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46320  serine peptidase  29.07 
 
 		 365 aa  73.6  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.497554  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1463  protease Do  30.95 
 
 		 467 aa  73.6  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.819915  normal  0.415171 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2485  serine protease  30.91 
 
 		 467 aa  72.8  0.000000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1364  protease Do  30.67 
 
 		 467 aa  72.8  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0372  PDZ/DHR/GLGF  30.27 
 
 		 377 aa  72  0.000000000008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.880544  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.08 
 
 		 385 aa  71.6  0.000000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.98033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0382  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.2 
 
 		 377 aa  72  0.000000000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.34875  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03095  serine endoprotease, periplasmic  34.68 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.874224  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0471  periplasmic serine protease DegS  34.68 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.183239  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3718  serine endoprotease  34.68 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00613349  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4552  serine endoprotease  34.68 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0248117  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0844  putative HtrA-like serine protease signal peptide protein  35.67 
 
 		 386 aa  71.2  0.00000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.765  normal  0.748774 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3052  peptidase S1C, HrtA/DegP2/Q/S  34.94 
 
 		 772 aa  71.6  0.00000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00233494  normal  0.413301 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03046  hypothetical protein  34.68 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.82301  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3424  serine endoprotease  34.68 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.109706  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5038  serine protease  34.15 
 
 		 464 aa  71.2  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.431803  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3531  serine endoprotease  34.68 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00943485  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1725  serine protease, putative  32.61 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.736757  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3541  serine endoprotease  34.68 
 
 		 355 aa  71.2  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.360038  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2184  trypsin-like serine protease  30.97 
 
 		 266 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2179  protease Do  31.52 
 
 		 494 aa  70.1  0.00000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20250  2-alkenal reductase  31.93 
 
 		 264 aa  70.1  0.00000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1776  2-alkenal reductase  31.49 
 
 		 411 aa  70.1  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.753058 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0471  serine endoprotease  34.1 
 
 		 355 aa  70.1  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.13577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3541  serine endoprotease  34.1 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03178  protease DO  32.18 
 
 		 446 aa  70.1  0.00000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0459704  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3540  serine endoprotease  34.1 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0189154  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3647  serine endoprotease  34.1 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3709  serine endoprotease  34.1 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.650789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3612  serine endoprotease  34.1 
 
 		 356 aa  70.5  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0709  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.29 
 
 		 388 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.675227 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0747  2-alkenal reductase  36.31 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.259793  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3175  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  32.47 
 
 		 394 aa  69.7  0.00000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.682155 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0784  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  36.31 
 
 		 379 aa  69.7  0.00000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0429954 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1841  peptidase S1C, Do  34.97 
 
 		 528 aa  69.7  0.00000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1518  protease Do  30.54 
 
 		 504 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.77603  normal  0.157004 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5887  protease Do  35.03 
 
 		 504 aa  69.7  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.685816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4914  serine protease  35.09 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.471766 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2320  PDZ/DHR/GLGF  29.73 
 
 		 351 aa  68.9  0.00000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.47953 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3362  peptidase S1C, Do  29.89 
 
 		 464 aa  68.9  0.00000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000016609  decreased coverage  0.00312332 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00878  protease  29.14 
 
 		 455 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3040  2-alkenal reductase  33.73 
 
 		 375 aa  69.3  0.00000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0397571 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0040  protease Do  27.27 
 
 		 484 aa  68.9  0.00000000006  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004514  outer membrane stress sensor protease DegQ  29.14 
 
 		 455 aa  69.3  0.00000000006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00186375  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0553  protease Do  30.73 
 
 		 456 aa  68.9  0.00000000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000923563  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2497  protease Do  29.89 
 
 		 488 aa  68.6  0.00000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2213  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.54 
 
 		 408 aa  68.9  0.00000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0322293  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1170  serine protease  31.74 
 
 		 474 aa  68.6  0.00000000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.143543  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1207  serine protease  31.74 
 
 		 474 aa  68.6  0.00000000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.653201  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1605  2-alkenal reductase  37.82 
 
 		 385 aa  68.6  0.00000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00436797 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2221  protease Do  29.89 
 
 		 488 aa  68.6  0.00000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.370789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2011  peptidase S1C, Do  31.61 
 
 		 526 aa  68.2  0.0000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.963752 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02461  serine protease  30.85 
 
 		 395 aa  67.8  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3611  2-alkenal reductase  33.33 
 
 		 396 aa  67  0.0000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.249525  normal  0.817359 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3096  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap:PDZ/DHR/GLGF  30.21 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.783782  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3670  serine endoprotease  32.95 
 
 		 369 aa  67.8  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.932831  normal  0.311262 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5515  2-alkenal reductase  35.67 
 
 		 383 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4915  2-alkenal reductase  34.46 
 
 		 385 aa  67.4  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000128637  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0288  serine endoprotease  33.52 
 
 		 370 aa  67  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.275018  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3233  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.73 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0601  PDZ/DHR/GLGF  30.51 
 
 		 361 aa  67  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.367147  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0619  2-alkenal reductase  28.81 
 
 		 394 aa  67.8  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16121  trypsin-like serine protease  31.71 
 
 		 370 aa  67  0.0000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3637  protease Do  31.71 
 
 		 463 aa  67.8  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.25969  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3546  2-alkenal reductase  27.73 
 
 		 407 aa  67  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.416625  hitchhiker  0.00882944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0261  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  32.53 
 
 		 396 aa  66.6  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0105515  hitchhiker  0.00601319 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0817  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  34.29 
 
 		 384 aa  67  0.0000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0667  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  29.63 
 
 		 376 aa  67  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1651  protease Do  31.58 
 
 		 492 aa  66.6  0.0000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.3942  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4295  protease Do  31.87 
 
 		 466 aa  66.6  0.0000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000836052  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1982  protease Do  29.14 
 
 		 476 aa  66.6  0.0000000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.358947  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_16701  trypsin-like serine protease  29.82 
 
 		 376 aa  66.2  0.0000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0418  2-alkenal reductase  30.23 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00163437 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1391  peptidase S1C, Do  30.49 
 
 		 496 aa  66.6  0.0000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.407109 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2041  protease Do  31.03 
 
 		 480 aa  66.6  0.0000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2857  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  33.93 
 
 		 394 aa  66.2  0.0000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.122647  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2668  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.23 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1183  HtrA2 peptidase  34.42 
 
 		 386 aa  66.2  0.0000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0439  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.23 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0366  2-alkenal reductase  30.23 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.850857  normal  0.376935 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0342  2-alkenal reductase  30.23 
 
 		 402 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.35857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3537  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.23 
 
 		 401 aa  66.2  0.0000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.727825 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2140  protease Do  32.34 
 
 		 523 aa  65.9  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.750781  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0357  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.23 
 
 		 401 aa  65.9  0.0000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.12639  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2947  2-alkenal reductase  35.53 
 
 		 374 aa  66.2  0.0000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1540  protease  33.33 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.107774  normal  0.168358 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1834  putative protease  30.2 
 
 		 396 aa  65.9  0.0000000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.308143 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>