70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Anae109_3999 on replicon NC_009675
Organism: Anaeromyxobacter sp. Fw109-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  100 
 
 
797 aa  1592    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.66 
 
 
648 aa  86.3  0.000000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  39.09 
 
 
1526 aa  85.1  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1214  hypothetical protein  34.2 
 
 
219 aa  75.9  0.000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.384546  hitchhiker  0.00043991 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  31.37 
 
 
314 aa  71.2  0.00000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  26.69 
 
 
292 aa  69.3  0.0000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2636  putative adenylate/guanylate cyclase  27.04 
 
 
611 aa  68.6  0.0000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.416157  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  28.48 
 
 
674 aa  68.2  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  35.78 
 
 
303 aa  67.4  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  36.07 
 
 
306 aa  65.5  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  36.53 
 
 
160 aa  62.4  0.00000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0796  hypothetical protein  31.25 
 
 
492 aa  62.4  0.00000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  31.21 
 
 
311 aa  61.2  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2302  WD-40 repeat protein  27.52 
 
 
1142 aa  59.7  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.616134 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  26.09 
 
 
290 aa  59.7  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  34.62 
 
 
160 aa  59.3  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  28.21 
 
 
374 aa  59.3  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  27.78 
 
 
291 aa  59.3  0.0000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  36.72 
 
 
158 aa  58.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  34.42 
 
 
165 aa  58.5  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  26.35 
 
 
1901 aa  57.8  0.0000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  29.01 
 
 
899 aa  57  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3771  hypothetical protein  35.06 
 
 
385 aa  55.8  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  33.33 
 
 
431 aa  55.5  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  26.58 
 
 
413 aa  53.1  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  37.4 
 
 
159 aa  53.1  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.93 
 
 
880 aa  52.8  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  24.06 
 
 
1052 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  23.93 
 
 
880 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  26.63 
 
 
829 aa  52.8  0.00003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0764  hypothetical protein  30.41 
 
 
600 aa  52  0.00004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  23.78 
 
 
157 aa  51.6  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  27.5 
 
 
262 aa  51.6  0.00005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  25 
 
 
255 aa  51.6  0.00006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  34.44 
 
 
156 aa  50.8  0.00009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  37.6 
 
 
170 aa  50.4  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0571  hypothetical protein  35.26 
 
 
564 aa  50.4  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  23.7 
 
 
1048 aa  50.8  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  30 
 
 
1611 aa  50.4  0.0001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  25 
 
 
1348 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  29.93 
 
 
598 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0547  TPR repeat-containing protein  38.74 
 
 
211 aa  50.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.980165  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  30.43 
 
 
485 aa  50.1  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4260  hypothetical protein  28.75 
 
 
391 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  22.05 
 
 
290 aa  49.3  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  25.93 
 
 
1656 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  27.39 
 
 
283 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  26.28 
 
 
441 aa  48.1  0.0007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  27.39 
 
 
283 aa  47.8  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0728  hypothetical protein  34 
 
 
173 aa  47.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.01 
 
 
1363 aa  47.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  24 
 
 
266 aa  47.4  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  28.06 
 
 
540 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  28.09 
 
 
404 aa  47.4  0.001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3110  peptidase S1 and S6, chymotrypsin/Hap  30.16 
 
 
239 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.411546  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  31.37 
 
 
157 aa  46.6  0.002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  26.36 
 
 
388 aa  46.6  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2916  hypothetical protein  33.33 
 
 
272 aa  46.6  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0912  hypothetical protein  23.91 
 
 
251 aa  45.8  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.251322  hitchhiker  0.0061785 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  27.35 
 
 
235 aa  45.4  0.004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  32.29 
 
 
570 aa  45.4  0.004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  34.38 
 
 
141 aa  45.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  23.68 
 
 
992 aa  45.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0510  hypothetical protein  30.95 
 
 
160 aa  45.1  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.320894 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5577  hypothetical protein  22.9 
 
 
265 aa  44.7  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3578  hypothetical protein  31.25 
 
 
387 aa  44.7  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0204  TIR protein  24.73 
 
 
360 aa  45.1  0.006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00447425  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4229  hypothetical protein  31.25 
 
 
387 aa  44.7  0.007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  24.79 
 
 
299 aa  44.3  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  24.55 
 
 
358 aa  44.3  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>