30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cphamn1_1380 on replicon NC_010831
Organism: Chlorobium phaeobacteroides BS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010831  Cphamn1_1380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  100 
 
 		 648 aa  1343    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.252149  hitchhiker  0.000910515 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3187  TPR repeat-containing protein  44.59 
 
 		 674 aa  533  1e-150  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00134162 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4937  hypothetical protein  38.02 
 
 		 1052 aa  443  1e-123  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.24473 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1214  hypothetical protein  55.91 
 
 		 219 aa  205  2e-51  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.384546  hitchhiker  0.00043991 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0547  TPR repeat-containing protein  52.13 
 
 		 211 aa  144  4e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.980165  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2231  hypothetical protein  30.7 
 
 		 441 aa  143  9.999999999999999e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.182669  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2477  hypothetical protein  29.86 
 
 		 441 aa  139  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5217  appr-1-p processing domain-containing protein  36.36 
 
 		 389 aa  105  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0611343  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0445  hypothetical protein  27.72 
 
 		 423 aa  101  4e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2513  hypothetical protein  26.22 
 
 		 668 aa  87.4  7e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0959259  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2788  hypothetical protein  36.61 
 
 		 244 aa  78.6  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0546  hypothetical protein  38.05 
 
 		 260 aa  78.6  0.0000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00000000516558  normal  0.0612145 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  25.22 
 
 		 797 aa  75.5  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5584  TPR repeat-containing protein  24.77 
 
 		 451 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2837  hypothetical protein  33.33 
 
 		 321 aa  67  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.115309  normal  0.203644 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2123  hypothetical protein  23.21 
 
 		 450 aa  66.2  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000309949  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0570  hypothetical protein  35.19 
 
 		 329 aa  64.7  0.000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  unclonable  0.0000000000288278  hitchhiker  0.00000228846 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4003  hypothetical protein  32.08 
 
 		 277 aa  61.6  0.00000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2748  hypothetical protein  35.19 
 
 		 280 aa  61.2  0.00000006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1463  hypothetical protein  27.72 
 
 		 635 aa  53.1  0.00002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0257  hypothetical protein  32.69 
 
 		 908 aa  52  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.737617 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2662  hypothetical protein  30.91 
 
 		 158 aa  51.2  0.00006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000658365  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4997  hypothetical protein  31.19 
 
 		 287 aa  50.8  0.00008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.042724 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2095  hypothetical protein  27.66 
 
 		 450 aa  50.4  0.00009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000101265 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2330  hypothetical protein  30.56 
 
 		 280 aa  50.4  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.644681  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0278  hypothetical protein  33.33 
 
 		 207 aa  48.9  0.0003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2636  putative adenylate/guanylate cyclase  23.78 
 
 		 611 aa  47  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.416157  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9834  hypothetical protein  31.43 
 
 		 306 aa  45.8  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3119  hypothetical protein  26.36 
 
 		 485 aa  46.2  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.245264  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5412  hypothetical protein  29.25 
 
 		 257 aa  45.4  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  unclonable  0.000000000178114  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>