18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3991 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  335  9.999999999999999e-92  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  58.75 
 
 		 160 aa  181  5.0000000000000004e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  55.97 
 
 		 160 aa  170  6.999999999999999e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  55.06 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  54.14 
 
 		 158 aa  154  6e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  50 
 
 		 165 aa  133  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0510  hypothetical protein  47.47 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.320894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0728  hypothetical protein  47.44 
 
 		 173 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  45.71 
 
 		 141 aa  115  1.9999999999999998e-25  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1480  hypothetical protein  45.57 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3982  hypothetical protein  42.68 
 
 		 172 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4906  hypothetical protein  49.64 
 
 		 139 aa  105  3e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  39.35 
 
 		 157 aa  97.4  7e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  37.97 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1464  hypothetical protein  28.83 
 
 		 551 aa  57.8  0.00000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2652  hypothetical protein  35.14 
 
 		 515 aa  51.2  0.000006  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  35.26 
 
 		 797 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1257  hypothetical protein  28.22 
 
 		 626 aa  43.1  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>