17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4906 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_4906  hypothetical protein  100 
 
 
139 aa  272  9e-73  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  56.72 
 
 
141 aa  141  3e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0728  hypothetical protein  55.65 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1480  hypothetical protein  56.92 
 
 
157 aa  122  1e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  52.52 
 
 
158 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  48.18 
 
 
157 aa  114  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3982  hypothetical protein  49.23 
 
 
172 aa  113  6.9999999999999995e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192734  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  49.6 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  48.41 
 
 
160 aa  107  7.000000000000001e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  49.64 
 
 
170 aa  105  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  49.28 
 
 
165 aa  103  1e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  48.59 
 
 
159 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  44.88 
 
 
156 aa  99.8  1e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0510  hypothetical protein  46.1 
 
 
160 aa  97.8  4e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.320894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2652  hypothetical protein  46 
 
 
515 aa  68.6  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1464  hypothetical protein  32.43 
 
 
551 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1257  hypothetical protein  30.08 
 
 
626 aa  48.9  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>