18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_0728 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009921  Franean1_0728  hypothetical protein  100 
 
 
173 aa  340  5.999999999999999e-93  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3982  hypothetical protein  55.06 
 
 
172 aa  178  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192734  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  51.43 
 
 
141 aa  132  3e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4906  hypothetical protein  55.65 
 
 
139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  47.44 
 
 
170 aa  127  7.000000000000001e-29  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1480  hypothetical protein  52.53 
 
 
157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  46.79 
 
 
158 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  45.62 
 
 
160 aa  121  5e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  44.59 
 
 
159 aa  112  3e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  40 
 
 
160 aa  109  2.0000000000000002e-23  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  42.31 
 
 
157 aa  109  2.0000000000000002e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  43.75 
 
 
165 aa  106  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  41.61 
 
 
156 aa  105  3e-22  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0510  hypothetical protein  40.76 
 
 
160 aa  102  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.320894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2652  hypothetical protein  38.36 
 
 
515 aa  56.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1464  hypothetical protein  30.67 
 
 
551 aa  53.9  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  34.53 
 
 
797 aa  44.3  0.0008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1257  hypothetical protein  27.94 
 
 
626 aa  42.4  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287082 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>