19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_0188 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  314  3e-85  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  52.56 
 
 		 156 aa  153  1e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  47.01 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4906  hypothetical protein  48.18 
 
 		 139 aa  114  3.9999999999999997e-25  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  40.13 
 
 		 158 aa  111  4.0000000000000004e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3982  hypothetical protein  40.13 
 
 		 172 aa  111  5e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0728  hypothetical protein  42.31 
 
 		 173 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  43.59 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1480  hypothetical protein  46.1 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  45.68 
 
 		 159 aa  103  7e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  39.35 
 
 		 170 aa  97.4  6e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  38.56 
 
 		 160 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  39.88 
 
 		 165 aa  91.7  3e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0510  hypothetical protein  35.22 
 
 		 160 aa  78.2  0.00000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.320894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2652  hypothetical protein  39.58 
 
 		 515 aa  75.5  0.0000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1257  hypothetical protein  34.5 
 
 		 626 aa  64.7  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1464  hypothetical protein  29.19 
 
 		 551 aa  60.1  0.00000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0764  hypothetical protein  28.42 
 
 		 600 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1801  hypothetical protein  32.81 
 
 		 726 aa  40.8  0.008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>