20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_0918 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  100 
 
 
158 aa  316  1e-85  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  62.26 
 
 
159 aa  187  5e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  58.6 
 
 
160 aa  172  1.9999999999999998e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  53.8 
 
 
160 aa  164  2.9999999999999998e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  58.79 
 
 
165 aa  156  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  54.14 
 
 
170 aa  154  5.0000000000000005e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0510  hypothetical protein  49.06 
 
 
160 aa  139  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.320894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  48.94 
 
 
141 aa  126  1.0000000000000001e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0728  hypothetical protein  46.79 
 
 
173 aa  126  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3982  hypothetical protein  42.95 
 
 
172 aa  122  2e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192734  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4906  hypothetical protein  52.52 
 
 
139 aa  118  3e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  42.86 
 
 
156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  40.13 
 
 
157 aa  111  4.0000000000000004e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1480  hypothetical protein  41.4 
 
 
157 aa  100  1e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1464  hypothetical protein  36.54 
 
 
551 aa  79  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1257  hypothetical protein  33.92 
 
 
626 aa  77.8  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2652  hypothetical protein  37.32 
 
 
515 aa  63.9  0.0000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  35.04 
 
 
797 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0764  hypothetical protein  27.66 
 
 
600 aa  42.7  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1801  hypothetical protein  48.78 
 
 
726 aa  41.2  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237059  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>