19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1271 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  315  1e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  77.85 
 
 
159 aa  229  1e-59  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  56.88 
 
 
160 aa  177  4e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  58.6 
 
 
158 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  55.97 
 
 
170 aa  170  5.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  53.37 
 
 
165 aa  143  1e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0510  hypothetical protein  45.68 
 
 
160 aa  122  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.320894 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0728  hypothetical protein  45.62 
 
 
173 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3982  hypothetical protein  41.88 
 
 
172 aa  114  6e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192734  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  42.77 
 
 
156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4906  hypothetical protein  49.6 
 
 
139 aa  112  3e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  43.59 
 
 
157 aa  108  3e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  48.8 
 
 
141 aa  102  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1480  hypothetical protein  42.77 
 
 
157 aa  96.7  1e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1464  hypothetical protein  34.42 
 
 
551 aa  71.2  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1257  hypothetical protein  30.59 
 
 
626 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287082 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  35.26 
 
 
797 aa  52.4  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2652  hypothetical protein  35.17 
 
 
515 aa  48.9  0.00003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0764  hypothetical protein  25 
 
 
600 aa  41.2  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>