16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C1257 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007953  Bxe_C1257  hypothetical protein  100 
 
 
626 aa  1264    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287082 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1464  hypothetical protein  23.17 
 
 
551 aa  103  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  33.92 
 
 
158 aa  77.8  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2652  hypothetical protein  36.71 
 
 
515 aa  72.8  0.00000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  40 
 
 
156 aa  66.2  0.000000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  34.5 
 
 
157 aa  65.1  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0764  hypothetical protein  29.03 
 
 
600 aa  63.2  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  29.24 
 
 
159 aa  56.2  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  30.59 
 
 
160 aa  55.5  0.000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  30.18 
 
 
165 aa  54.3  0.000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  30 
 
 
160 aa  52.4  0.00002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4906  hypothetical protein  30.08 
 
 
139 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1480  hypothetical protein  44.23 
 
 
157 aa  48.5  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  31.9 
 
 
141 aa  47.8  0.0007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1801  hypothetical protein  24.51 
 
 
726 aa  45.1  0.004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.237059  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  28.22 
 
 
170 aa  43.5  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>