18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1480 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1480  hypothetical protein  100 
 
 
157 aa  311  2.9999999999999996e-84  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  60.71 
 
 
141 aa  164  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0728  hypothetical protein  52.53 
 
 
173 aa  144  6e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4906  hypothetical protein  56.92 
 
 
139 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3982  hypothetical protein  45.57 
 
 
172 aa  132  1.9999999999999998e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192734  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  45.57 
 
 
170 aa  130  6e-30  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  46.1 
 
 
157 aa  124  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  46.2 
 
 
159 aa  120  8e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0510  hypothetical protein  44.65 
 
 
160 aa  119  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.320894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  41.4 
 
 
158 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  46.2 
 
 
156 aa  117  6e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  42.77 
 
 
160 aa  116  9.999999999999999e-26  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  40.88 
 
 
160 aa  110  9e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  41.72 
 
 
165 aa  100  8e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1464  hypothetical protein  31.13 
 
 
551 aa  64.3  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2652  hypothetical protein  35.86 
 
 
515 aa  63.9  0.0000000007  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1257  hypothetical protein  35.34 
 
 
626 aa  50.8  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0764  hypothetical protein  25.43 
 
 
600 aa  48.1  0.00005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>