18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_0510 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_0510  hypothetical protein  100 
 
 
160 aa  316  7e-86  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.320894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  49.06 
 
 
158 aa  148  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  49.06 
 
 
159 aa  141  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  45.68 
 
 
160 aa  134  7.000000000000001e-31  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  47.47 
 
 
170 aa  132  9.999999999999999e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  46.3 
 
 
160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1480  hypothetical protein  44.65 
 
 
157 aa  112  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  45.45 
 
 
141 aa  110  9e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4906  hypothetical protein  46.1 
 
 
139 aa  104  4e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0728  hypothetical protein  40.76 
 
 
173 aa  104  6e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  42.68 
 
 
165 aa  102  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3982  hypothetical protein  38.22 
 
 
172 aa  99  2e-20  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192734  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  41.13 
 
 
156 aa  85.1  4e-16  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  35.22 
 
 
157 aa  84.7  5e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1464  hypothetical protein  28.66 
 
 
551 aa  61.2  0.000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2652  hypothetical protein  35.42 
 
 
515 aa  59.3  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1257  hypothetical protein  28.16 
 
 
626 aa  45.8  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287082 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  31.61 
 
 
797 aa  41.2  0.005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.703882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>