18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1464 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011060  Ppha_1464  hypothetical protein  100 
 
 
551 aa  1135    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2652  hypothetical protein  25.73 
 
 
515 aa  178  3e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1257  hypothetical protein  32.61 
 
 
626 aa  84.3  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287082 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  36.54 
 
 
158 aa  79  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  32.26 
 
 
165 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  34.42 
 
 
160 aa  71.2  0.00000000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  39.81 
 
 
156 aa  70.1  0.0000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  37.72 
 
 
141 aa  66.2  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  33.12 
 
 
160 aa  65.5  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  30.67 
 
 
159 aa  59.7  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  29.19 
 
 
157 aa  60.1  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0764  hypothetical protein  24.58 
 
 
600 aa  58.9  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  28.83 
 
 
170 aa  57.8  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0510  hypothetical protein  28.03 
 
 
160 aa  55.8  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.320894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4906  hypothetical protein  32.43 
 
 
139 aa  56.2  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3982  hypothetical protein  31.21 
 
 
172 aa  56.2  0.000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0728  hypothetical protein  30.67 
 
 
173 aa  53.9  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1480  hypothetical protein  31.13 
 
 
157 aa  53.5  0.000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  0.52003 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>