17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_3982 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_3982  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  340  8e-93  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0728  hypothetical protein  55.06 
 
 		 173 aa  178  2.9999999999999997e-44  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  50.36 
 
 		 141 aa  137  1e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  42.95 
 
 		 158 aa  122  2e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1480  hypothetical protein  45.57 
 
 		 157 aa  114  5e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  41.88 
 
 		 160 aa  114  6.9999999999999995e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4906  hypothetical protein  49.23 
 
 		 139 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  40.13 
 
 		 157 aa  111  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  40.88 
 
 		 156 aa  110  1.0000000000000001e-23  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  42.68 
 
 		 170 aa  109  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  40.38 
 
 		 159 aa  105  3e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  37.5 
 
 		 160 aa  100  1e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0510  hypothetical protein  38.22 
 
 		 160 aa  94.7  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.320894 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  41.67 
 
 		 165 aa  91.7  5e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2652  hypothetical protein  34.93 
 
 		 515 aa  60.5  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1464  hypothetical protein  31.21 
 
 		 551 aa  56.2  0.0000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0764  hypothetical protein  26.8 
 
 		 600 aa  51.2  0.000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>