19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_13760 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  100 
 
 
156 aa  314  2e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  52.56 
 
 
157 aa  153  9e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  54.33 
 
 
141 aa  124  4.0000000000000003e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  42.86 
 
 
158 aa  113  1.0000000000000001e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  42.77 
 
 
160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  45.45 
 
 
160 aa  111  4.0000000000000004e-24  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3982  hypothetical protein  40.88 
 
 
172 aa  110  9e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192734  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0728  hypothetical protein  41.61 
 
 
173 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1480  hypothetical protein  46.2 
 
 
157 aa  100  6e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  50 
 
 
159 aa  100  1e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4906  hypothetical protein  44.88 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  37.97 
 
 
170 aa  95.9  2e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  42.5 
 
 
165 aa  93.6  1e-18  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0510  hypothetical protein  41.13 
 
 
160 aa  76.6  0.0000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.320894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2652  hypothetical protein  38.57 
 
 
515 aa  70.5  0.000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1464  hypothetical protein  39.81 
 
 
551 aa  70.1  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1257  hypothetical protein  34.3 
 
 
626 aa  66.2  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0287082 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0764  hypothetical protein  27.91 
 
 
600 aa  43.9  0.0008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  32.86 
 
 
797 aa  40.4  0.01  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.703882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>