19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Amir_5211 on replicon NC_013093
Organism: Actinosynnema mirum DSM 43827



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013093  Amir_5211  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  325  2.0000000000000001e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.001702  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0918  hypothetical protein  58.79 
 
 		 158 aa  174  5e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1245  hypothetical protein  55.76 
 
 		 159 aa  160  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.218188  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1271  hypothetical protein  53.37 
 
 		 160 aa  160  7e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.383766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3991  hypothetical protein  50 
 
 		 170 aa  144  8.000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3335  hypothetical protein  43.29 
 
 		 160 aa  124  4.0000000000000003e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0728  hypothetical protein  44.72 
 
 		 173 aa  120  6e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.512117  normal  0.0869756 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1814  hypothetical protein  50.79 
 
 		 141 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.974871  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4906  hypothetical protein  49.28 
 
 		 139 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0510  hypothetical protein  42.68 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.799132  normal  0.320894 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13760  hypothetical protein  42.5 
 
 		 156 aa  112  2.0000000000000002e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.639119  normal  0.988023 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0188  hypothetical protein  39.88 
 
 		 157 aa  105  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3982  hypothetical protein  40.99 
 
 		 172 aa  103  1e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.192734  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1480  hypothetical protein  40.49 
 
 		 157 aa  98.6  3e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.241335  normal  0.52003 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1464  hypothetical protein  31.06 
 
 		 551 aa  77  0.0000000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1257  hypothetical protein  30.86 
 
 		 626 aa  60.8  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0287082 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2652  hypothetical protein  34.97 
 
 		 515 aa  60.1  0.00000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0764  hypothetical protein  27.81 
 
 		 600 aa  49.3  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.405615  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  33.8 
 
 		 797 aa  47.8  0.00007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>