36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0275 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  100 
 
 		 290 aa  604  9.999999999999999e-173  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  42.08 
 
 		 513 aa  163  3e-39  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  46.88 
 
 		 316 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  41.88 
 
 		 549 aa  132  5e-30  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  36.97 
 
 		 482 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1816  hypothetical protein  31.77 
 
 		 398 aa  109  5e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  36.49 
 
 		 775 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0525  SEFIR domain-containing protein  32.08 
 
 		 553 aa  99.4  7e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0577741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2788  SEFIR domain protein  32.53 
 
 		 489 aa  96.3  5e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0246678  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2477  hypothetical protein  30.46 
 
 		 439 aa  91.3  2e-17  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.00283932  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  31.43 
 
 		 324 aa  89.4  6e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  30 
 
 		 527 aa  67  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 1526 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3997  SEFIR domain protein  28.66 
 
 		 293 aa  60.1  0.00000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.565957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1793  hypothetical protein  30.3 
 
 		 1149 aa  58.9  0.00000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  27.03 
 
 		 303 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  30.69 
 
 		 266 aa  53.9  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0751  hypothetical protein  32.81 
 
 		 313 aa  53.9  0.000003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.309445 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2873  SEFIR domain protein  26.58 
 
 		 830 aa  52.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.205836  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  26.26 
 
 		 311 aa  48.1  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  33.82 
 
 		 859 aa  47.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 911 aa  47.4  0.0003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  34.33 
 
 		 540 aa  47  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  36.11 
 
 		 314 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  36.76 
 
 		 992 aa  46.6  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  30.14 
 
 		 235 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  25.82 
 
 		 404 aa  45.8  0.0008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  29.85 
 
 		 385 aa  45.8  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  23.5 
 
 		 413 aa  45.8  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  30.89 
 
 		 306 aa  45.8  0.0009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 785 aa  45.4  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  41.94 
 
 		 367 aa  45.4  0.001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  27.69 
 
 		 388 aa  44.3  0.002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  29.85 
 
 		 1901 aa  43.9  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0493  hypothetical protein  23.08 
 
 		 1046 aa  43.1  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00353648  decreased coverage  0.00104497 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  35.94 
 
 		 900 aa  42.4  0.008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>