25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0366 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  100 
 
 		 262 aa  548  1e-155  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1624  TIR protein  49.24 
 
 		 330 aa  151  8e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2207  hypothetical protein  50.37 
 
 		 401 aa  145  5e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0254  TIR (Toll-Interleukin 1-resistance) domain containing protein-like protein  46.97 
 
 		 279 aa  129  5.0000000000000004e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1450  hypothetical protein  37.4 
 
 		 362 aa  93.6  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.252618  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1561  protein of unknown function DUF323  35.38 
 
 		 361 aa  75.9  0.0000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5586  ATPase  30.22 
 
 		 504 aa  75.1  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0735  hypothetical protein  32.58 
 
 		 277 aa  72.4  0.000000000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0731  hypothetical protein  32.58 
 
 		 325 aa  72.4  0.000000000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3653  ATPas  29.52 
 
 		 487 aa  68.6  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  5.96179e-19  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0382  hypothetical protein  33.88 
 
 		 490 aa  65.5  0.0000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.854093 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  27.97 
 
 		 1526 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1772  WD repeat-containing protein  25.71 
 
 		 981 aa  60.8  0.00000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  32.09 
 
 		 293 aa  59.7  0.00000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_003296  RS02992  hypothetical protein  31.4 
 
 		 521 aa  59.3  0.00000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  unclonable  0.000000718056  normal  0.615169 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4938  hypothetical protein  29.7 
 
 		 167 aa  53.1  0.000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  35.71 
 
 		 255 aa  49.3  0.00007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  27.5 
 
 		 797 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  26.92 
 
 		 238 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  26.92 
 
 		 237 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  29.73 
 
 		 306 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  24.74 
 
 		 331 aa  45.8  0.0008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  30.3 
 
 		 541 aa  45.4  0.0009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  24.28 
 
 		 290 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  26.55 
 
 		 303 aa  42.4  0.007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>