17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2916 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007498  Pcar_2916  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  547  1e-155  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4229  hypothetical protein  67.16 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3578  hypothetical protein  67.16 
 
 
387 aa  405  1.0000000000000001e-112  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3771  hypothetical protein  53.12 
 
 
385 aa  281  8.000000000000001e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1272  hypothetical protein  49.25 
 
 
380 aa  265  5.999999999999999e-70  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2635  hypothetical protein  48.88 
 
 
380 aa  264  1e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0162237 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4260  hypothetical protein  36.67 
 
 
391 aa  187  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0534  hypothetical protein  36.78 
 
 
356 aa  51.6  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.656053  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3047  hypothetical protein  33.33 
 
 
292 aa  47  0.0003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0481  hypothetical protein  22.68 
 
 
163 aa  45.1  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  29.41 
 
 
1348 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  32.47 
 
 
137 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  30.39 
 
 
1363 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2180  hypothetical protein  35.06 
 
 
358 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2293  hypothetical protein  35.06 
 
 
358 aa  43.5  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.120131  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4744  hypothetical protein  32.18 
 
 
396 aa  43.9  0.003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  26.42 
 
 
1048 aa  42.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>