22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5577 on replicon NC_011732
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011732  PCC7424_5577  hypothetical protein  100 
 
 		 265 aa  543  1e-153  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.52 
 
 		 406 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.52 
 
 		 406 aa  95.9  7e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5675  Pyrrolo-quinoline quinone  30.88 
 
 		 994 aa  57.8  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  26.76 
 
 		 1526 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  30 
 
 		 291 aa  55.5  0.0000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0269  hypothetical protein  30.77 
 
 		 195 aa  54.7  0.000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.108769  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  29.35 
 
 		 299 aa  48.5  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  29.5 
 
 		 1656 aa  46.6  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  28.26 
 
 		 255 aa  46.2  0.0006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  25.51 
 
 		 314 aa  45.4  0.0009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  30.65 
 
 		 303 aa  45.1  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  30.43 
 
 		 1016 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  30.43 
 
 		 1016 aa  43.1  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  28.12 
 
 		 541 aa  43.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  27.5 
 
 		 485 aa  42.7  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0481  hypothetical protein  24.83 
 
 		 163 aa  42.7  0.006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1727  hypothetical protein  28.71 
 
 		 125 aa  42.4  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  23.91 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  37.5 
 
 		 1611 aa  42.4  0.008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.14 
 
 		 1363 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  23.91 
 
 		 283 aa  42.4  0.008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>