191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_2302 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011059  Paes_2302  WD-40 repeat protein  100 
 
 		 1142 aa  2361    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.616134 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1253  WD-40 repeat protein  40.13 
 
 		 960 aa  230  1e-58  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.33 
 
 		 1481 aa  143  1.9999999999999998e-32  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.97 
 
 		 1510 aa  128  7e-28  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  21.5 
 
 		 1553 aa  123  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0959  hypothetical protein  43.48 
 
 		 177 aa  123  1.9999999999999998e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.246804  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1061  hypothetical protein  43.75 
 
 		 188 aa  110  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  21.34 
 
 		 1229 aa  107  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.68 
 
 		 919 aa  97.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  23.11 
 
 		 1217 aa  92.8  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.45 
 
 		 1163 aa  90.9  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0744  hypothetical protein  38.71 
 
 		 177 aa  90.1  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  20.92 
 
 		 947 aa  88.2  8e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  25 
 
 		 696 aa  87.8  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  20.89 
 
 		 1363 aa  87.4  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  23.08 
 
 		 1656 aa  84.7  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  22.06 
 
 		 1364 aa  84.3  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.32 
 
 		 1652 aa  84.3  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  22.38 
 
 		 1193 aa  82.4  0.00000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  22.3 
 
 		 1196 aa  80.9  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  19.75 
 
 		 1831 aa  80.5  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  20.79 
 
 		 1161 aa  80.1  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  21.34 
 
 		 1161 aa  80.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  23.67 
 
 		 1901 aa  79.7  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1841  WD-40 repeat-containing protein  23.27 
 
 		 1661 aa  79.3  0.0000000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6431  WD-40 repeat protein  23.55 
 
 		 1766 aa  78.6  0.0000000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.903065  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  22.28 
 
 		 1474 aa  79  0.0000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  22.2 
 
 		 1807 aa  78.6  0.0000000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.68 
 
 		 1599 aa  77.8  0.000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  21.56 
 
 		 1188 aa  77  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6918  transcriptional regulator, XRE family  25.79 
 
 		 1334 aa  75.9  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00260237  hitchhiker  0.000100378 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1377  hypothetical protein  32.52 
 
 		 176 aa  75.9  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0169479  normal  0.0251034 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.76 
 
 		 1221 aa  75.1  0.000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  19.76 
 
 		 1262 aa  74.7  0.000000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3923  WD-40 repeat-containing protein  22.74 
 
 		 1789 aa  74.7  0.000000000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.161753 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  23.97 
 
 		 1357 aa  74.7  0.000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  23.21 
 
 		 1209 aa  74.3  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  22.58 
 
 		 1454 aa  73.2  0.00000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  21.83 
 
 		 1523 aa  73.6  0.00000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  28.68 
 
 		 1411 aa  72.4  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  21.87 
 
 		 1348 aa  71.2  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  22.13 
 
 		 1247 aa  70.9  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6227  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.53 
 
 		 943 aa  70.1  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.174955 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  21.06 
 
 		 1399 aa  69.7  0.0000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43349  predicted protein  30.46 
 
 		 651 aa  69.3  0.0000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  20.59 
 
 		 1213 aa  68.6  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.01 
 
 		 1557 aa  67.8  0.000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  21.98 
 
 		 1188 aa  67  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  21.88 
 
 		 1236 aa  65.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  23.7 
 
 		 434 aa  65.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5605  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  20.79 
 
 		 1823 aa  65.9  0.000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.899312  normal  0.15288 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  21.86 
 
 		 1214 aa  65.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0315  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  21.86 
 
 		 924 aa  65.1  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1433  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.67 
 
 		 1583 aa  64.3  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  19.58 
 
 		 1211 aa  64.7  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  23.14 
 
 		 443 aa  64.3  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.91 
 
 		 1686 aa  63.5  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.13 
 
 		 930 aa  63.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2891  WD-40 repeat-containing protein  21.54 
 
 		 1714 aa  63.2  0.00000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00238858 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0575  Serine/threonine protein kinase-related protein  20.18 
 
 		 1856 aa  62.8  0.00000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  24.8 
 
 		 464 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3934  WD-40 repeat-containing protein  24.79 
 
 		 1599 aa  62.8  0.00000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.146607  unclonable  0.000100505 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  24.07 
 
 		 596 aa  63.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  27.12 
 
 		 522 aa  62.8  0.00000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_15280  predicted protein  29.44 
 
 		 534 aa  62.8  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  21.17 
 
 		 1242 aa  62.4  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  24.59 
 
 		 565 aa  62  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  19.83 
 
 		 1760 aa  61.6  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  21.71 
 
 		 1190 aa  61.6  0.00000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3437  WD-40 repeat protein  19.12 
 
 		 1160 aa  60.8  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.67443  normal  0.247289 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  20.87 
 
 		 1208 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  21.3 
 
 		 1443 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.74 
 
 		 664 aa  60.1  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  21.49 
 
 		 1355 aa  60.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  21.24 
 
 		 1344 aa  59.7  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  22.33 
 
 		 1190 aa  59.3  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  19.46 
 
 		 1868 aa  59.3  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  25.19 
 
 		 335 aa  58.9  0.0000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.53 
 
 		 698 aa  58.9  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  22.89 
 
 		 1164 aa  58.9  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  20.49 
 
 		 1330 aa  58.9  0.0000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  27.71 
 
 		 344 aa  58.5  0.0000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.71 
 
 		 1004 aa  58.2  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5120  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  25.85 
 
 		 490 aa  57.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.413243 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  24.68 
 
 		 504 aa  58.2  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1624  WD-40 repeat-containing protein  22.55 
 
 		 1176 aa  57.4  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.228401 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  25 
 
 		 316 aa  57  0.000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  22.85 
 
 		 1183 aa  57  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  24.45 
 
 		 1477 aa  57  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  23.36 
 
 		 316 aa  57.4  0.000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.24 
 
 		 630 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.45 
 
 		 622 aa  57.4  0.000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0103  WD-40 repeat-containing protein  19.47 
 
 		 1209 aa  57  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.572371  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.54 
 
 		 1711 aa  56.2  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  21.03 
 
 		 608 aa  56.6  0.000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7085  WD-40 repeat-containing protein  22.5 
 
 		 1265 aa  56.2  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  24.71 
 
 		 790 aa  55.8  0.000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  30.32 
 
 		 1427 aa  55.5  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.68 
 
 		 1240 aa  55.1  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.55 
 
 		 792 aa  55.1  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>