47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_0319 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  100 
 
 		 157 aa  323  5e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  49.37 
 
 		 1068 aa  147  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  45.33 
 
 		 785 aa  134  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  44.44 
 
 		 911 aa  134  5e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  46.51 
 
 		 388 aa  131  3e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  45.99 
 
 		 235 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  44.83 
 
 		 238 aa  128  3e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  43.45 
 
 		 237 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  43.31 
 
 		 374 aa  115  1.9999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  42.66 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-24  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  42.86 
 
 		 934 aa  108  4.0000000000000004e-23  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  39.58 
 
 		 266 aa  107  8.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  40.14 
 
 		 1901 aa  106  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  43.06 
 
 		 829 aa  105  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  43.54 
 
 		 405 aa  106  2e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  42.36 
 
 		 899 aa  102  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  39.86 
 
 		 705 aa  101  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  41.29 
 
 		 564 aa  101  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  38.41 
 
 		 1355 aa  101  5e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  40.4 
 
 		 850 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  40.94 
 
 		 540 aa  99.4  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  40.71 
 
 		 161 aa  98.6  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  41.22 
 
 		 715 aa  97.1  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  40.28 
 
 		 385 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  44.54 
 
 		 963 aa  92.4  2e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  35.03 
 
 		 464 aa  91.3  4e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  37.93 
 
 		 859 aa  87.8  5e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  37.59 
 
 		 1056 aa  86.7  1e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  37.19 
 
 		 992 aa  80.5  0.000000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  34.93 
 
 		 897 aa  76.6  0.0000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  37.39 
 
 		 900 aa  73.9  0.0000000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  30 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  33.85 
 
 		 793 aa  66.2  0.0000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  31.52 
 
 		 524 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  31.65 
 
 		 1309 aa  55.1  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 1526 aa  54.3  0.0000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  23.78 
 
 		 797 aa  48.1  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  27.03 
 
 		 367 aa  47  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  29.57 
 
 		 570 aa  47  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  28.33 
 
 		 413 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  24.07 
 
 		 292 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  30.77 
 
 		 404 aa  45.1  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  28.07 
 
 		 1611 aa  43.1  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  22.4 
 
 		 291 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  22.64 
 
 		 290 aa  42  0.003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  20.18 
 
 		 290 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  24.83 
 
 		 314 aa  40.8  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>