46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA3012 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  100 
 
 		 314 aa  628  1e-179  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  38.85 
 
 		 311 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  43.1 
 
 		 1611 aa  85.9  9e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  34.53 
 
 		 291 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  29.94 
 
 		 404 aa  79.3  0.00000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  30.99 
 
 		 413 aa  78.6  0.0000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  34.62 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  34.26 
 
 		 303 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  31.3 
 
 		 1526 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  35.19 
 
 		 292 aa  68.2  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  39.56 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3999  TIR protein  31.37 
 
 		 797 aa  64.3  0.000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.703882 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  37.36 
 
 		 299 aa  64.3  0.000000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  29.27 
 
 		 367 aa  63.9  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1565  restriction endonuclease  27.46 
 
 		 290 aa  63.2  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.380893 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  38.2 
 
 		 293 aa  62  0.00000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0746  TIR protein  32.58 
 
 		 598 aa  60.8  0.00000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  37.78 
 
 		 275 aa  59.3  0.00000009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  29.94 
 
 		 513 aa  58.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1857  SEFIR domain-containing protein  25.9 
 
 		 482 aa  57  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1885  SEFIR domain protein  30.06 
 
 		 549 aa  57  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  36.26 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  36.26 
 
 		 283 aa  56.6  0.0000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1660  sefir domain protein  27.39 
 
 		 316 aa  55.8  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1135  SEFIR domain-containing protein  28.66 
 
 		 324 aa  54.7  0.000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2339  protein of unknown function DUF323  39.71 
 
 		 775 aa  52.8  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6700  hypothetical protein  33.02 
 
 		 306 aa  52.8  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0587904 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4288  TIR protein  26.12 
 
 		 138 aa  50.1  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  31.73 
 
 		 541 aa  50.1  0.00006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1036  SEFIR domain protein  31.75 
 
 		 527 aa  48.9  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  33.33 
 
 		 570 aa  48.9  0.0001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  32.43 
 
 		 441 aa  47.4  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0275  SEFIR domain-containing protein  36.11 
 
 		 290 aa  47.4  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  25.15 
 
 		 1901 aa  47.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1939  glycoside hydrolase family 16  27.37 
 
 		 566 aa  47  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000600804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0066  hypothetical protein  32.08 
 
 		 384 aa  46.2  0.0007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3643  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 406 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2471  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 406 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0400427  normal  0.45906 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5577  hypothetical protein  25.51 
 
 		 265 aa  45.4  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3018  hypothetical protein  26.77 
 
 		 441 aa  44.3  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00034439  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  25 
 
 		 374 aa  44.7  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.88 
 
 		 947 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1040  protein of unknown function DUF323  31.07 
 
 		 517 aa  43.5  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0229948  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  31.08 
 
 		 331 aa  43.1  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0104  hypothetical protein  29.31 
 
 		 386 aa  42.7  0.007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  29.17 
 
 		 357 aa  42.4  0.01  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>