66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_1263 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  100 
 
 		 255 aa  517  1e-146  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  51.89 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  51.89 
 
 		 283 aa  239  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  53.09 
 
 		 293 aa  175  7e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  52.24 
 
 		 275 aa  151  8e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  50.38 
 
 		 299 aa  146  4.0000000000000006e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  49.14 
 
 		 541 aa  126  3e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4885  hypothetical protein  64.86 
 
 		 205 aa  110  3e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2265  hypothetical protein  64.86 
 
 		 101 aa  109  5e-23  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.310683  normal  0.0284056 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3142  hypothetical protein  34.81 
 
 		 231 aa  88.6  9e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3704  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 233 aa  85.9  6e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1061  hypothetical protein  31.62 
 
 		 243 aa  83.2  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354212  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1465  hypothetical protein  37.11 
 
 		 103 aa  82.4  0.000000000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.904043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0020  hypothetical protein  32.06 
 
 		 239 aa  82  0.000000000000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199965 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1366  hypothetical protein  38.14 
 
 		 103 aa  81.3  0.00000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222726  normal  1 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0047  hypothetical protein  31.65 
 
 		 234 aa  81.6  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000487124  normal  0.972099 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1430  putative lipoprotein  31.61 
 
 		 227 aa  81.6  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5375  hypothetical protein  31.79 
 
 		 233 aa  80.9  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000248774  hitchhiker  0.0000712008 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3546  hypothetical protein  32.84 
 
 		 131 aa  80.1  0.00000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.222814  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0971  hypothetical protein  32.09 
 
 		 242 aa  79.3  0.00000000000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2265  hypothetical protein  38.37 
 
 		 101 aa  78.6  0.0000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  31.3 
 
 		 265 aa  77  0.0000000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  38.04 
 
 		 404 aa  73.2  0.000000000004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  42.55 
 
 		 291 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  36.17 
 
 		 1526 aa  69.3  0.00000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  31.3 
 
 		 413 aa  69.3  0.00000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  38.66 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  39.56 
 
 		 314 aa  65.5  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2592  hypothetical protein  46.27 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2983  hypothetical protein  29.41 
 
 		 101 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41097  normal  0.441855 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40710  hypothetical protein  30.99 
 
 		 120 aa  55.5  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3452  hypothetical protein  30.99 
 
 		 100 aa  55.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.242056  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3116  hypothetical protein  29.63 
 
 		 101 aa  54.7  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0194652  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3194  hypothetical protein  29.58 
 
 		 100 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  35.16 
 
 		 311 aa  53.1  0.000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1945  hypothetical protein  28.17 
 
 		 100 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3825  hypothetical protein  28.17 
 
 		 100 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.562405  normal  0.302705 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3540  hypothetical protein  28.17 
 
 		 100 aa  52.4  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00970337 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0961  WD-40 repeat protein  27.93 
 
 		 1279 aa  52  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.919157  normal  0.503746 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2934  hypothetical protein  28.57 
 
 		 100 aa  51.6  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  27.93 
 
 		 1279 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  30.08 
 
 		 1048 aa  50.8  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2157  hypothetical protein  29.58 
 
 		 97 aa  50.8  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159271  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0366  hypothetical protein  35.71 
 
 		 262 aa  49.3  0.00006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  34.44 
 
 		 1348 aa  48.9  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2632  hypothetical protein  32.95 
 
 		 292 aa  48.9  0.00008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.801014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  31.68 
 
 		 1656 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  31.11 
 
 		 1611 aa  47.8  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  39.39 
 
 		 367 aa  47  0.0003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  26.85 
 
 		 357 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  25.53 
 
 		 1373 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5590  hypothetical protein  29.17 
 
 		 431 aa  46.2  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011732  PCC7424_5577  hypothetical protein  28.26 
 
 		 265 aa  46.2  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1298  ankyrin  24.09 
 
 		 797 aa  45.1  0.001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  32.61 
 
 		 947 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  30.77 
 
 		 303 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  24.49 
 
 		 1363 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0553  hypothetical protein  33.9 
 
 		 473 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.513791  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3771  hypothetical protein  27.36 
 
 		 385 aa  43.1  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1222  pentapeptide repeat protein  27.37 
 
 		 331 aa  42.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.154284  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1625  hypothetical protein  28.3 
 
 		 290 aa  42.7  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0545  hypothetical protein  30.14 
 
 		 969 aa  42.4  0.007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.963711 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1220  pentapeptide repeat protein  26.32 
 
 		 441 aa  42  0.009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  35.38 
 
 		 1068 aa  42  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  34.18 
 
 		 570 aa  42  0.009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  31.19 
 
 		 880 aa  42  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>