15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pfl01_2934 on replicon NC_007492
Organism: Pseudomonas fluorescens Pf0-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2934  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  208  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3825  hypothetical protein  87.88 
 
 		 100 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.562405  normal  0.302705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1945  hypothetical protein  87.88 
 
 		 100 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3540  hypothetical protein  87.88 
 
 		 100 aa  186  1e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00970337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3194  hypothetical protein  86.87 
 
 		 100 aa  184  3e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40710  hypothetical protein  80 
 
 		 120 aa  176  7e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3116  hypothetical protein  79.21 
 
 		 101 aa  175  2e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0194652  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3452  hypothetical protein  79 
 
 		 100 aa  174  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.242056  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2983  hypothetical protein  78.22 
 
 		 101 aa  171  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41097  normal  0.441855 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2157  hypothetical protein  73.2 
 
 		 97 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159271  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  28.57 
 
 		 255 aa  51.6  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2265  hypothetical protein  30.16 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1366  hypothetical protein  33.93 
 
 		 103 aa  41.6  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222726  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  33.93 
 
 		 283 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  33.93 
 
 		 283 aa  40  0.01  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>