14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_3116 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_3116  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  213  8e-55  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0194652  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2983  hypothetical protein  97.03 
 
 		 101 aa  206  1e-52  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.41097  normal  0.441855 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2934  hypothetical protein  79.21 
 
 		 100 aa  175  2e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3825  hypothetical protein  78 
 
 		 100 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.562405  normal  0.302705 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1945  hypothetical protein  78 
 
 		 100 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3540  hypothetical protein  78 
 
 		 100 aa  166  1e-40  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00970337 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3194  hypothetical protein  77 
 
 		 100 aa  165  2e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_40710  hypothetical protein  77 
 
 		 120 aa  161  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3452  hypothetical protein  76 
 
 		 100 aa  159  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.242056  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2157  hypothetical protein  69.47 
 
 		 97 aa  144  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00159271  normal  0.0779555 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  29.63 
 
 		 255 aa  54.7  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2265  hypothetical protein  28.79 
 
 		 101 aa  47.8  0.00005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1366  hypothetical protein  35.59 
 
 		 103 aa  45.4  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.222726  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1465  hypothetical protein  37.29 
 
 		 103 aa  43.9  0.0007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.904043  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>