22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YpsIP31758_3704 on replicon NC_009708
Organism: Yersinia pseudotuberculosis IP 31758



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009708  YpsIP31758_3704  putative lipoprotein  100 
 
 		 233 aa  474  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1430  putative lipoprotein  82.4 
 
 		 227 aa  355  3.9999999999999996e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5375  hypothetical protein  82.83 
 
 		 233 aa  323  1e-87  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000248774  hitchhiker  0.0000712008 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0047  hypothetical protein  62.29 
 
 		 234 aa  296  3e-79  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000487124  normal  0.972099 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0020  hypothetical protein  64.17 
 
 		 239 aa  284  8e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199965 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0971  hypothetical protein  62.14 
 
 		 242 aa  267  1e-70  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3142  hypothetical protein  60.25 
 
 		 231 aa  261  8e-69  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1061  hypothetical protein  65.38 
 
 		 243 aa  246  3e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354212  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3546  hypothetical protein  75.57 
 
 		 131 aa  204  8e-52  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.222814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  33.33 
 
 		 255 aa  85.9  6e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  35.06 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  35.06 
 
 		 283 aa  82  0.000000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  33.09 
 
 		 293 aa  80.5  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  33.33 
 
 		 275 aa  79  0.00000000000005  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  30.66 
 
 		 299 aa  74.7  0.000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  31.25 
 
 		 541 aa  70.5  0.00000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  27.41 
 
 		 265 aa  68.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  29.47 
 
 		 1048 aa  49.7  0.00004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  27.37 
 
 		 1363 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  35.38 
 
 		 413 aa  48.1  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 		 1373 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  25.73 
 
 		 374 aa  41.6  0.01  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>