22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_1430 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_1430  putative lipoprotein  100 
 
 
227 aa  461  1e-129  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3704  putative lipoprotein  81.12 
 
 
233 aa  328  3e-89  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5375  hypothetical protein  80.26 
 
 
233 aa  315  5e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000248774  hitchhiker  0.0000712008 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0020  hypothetical protein  66.25 
 
 
239 aa  297  1e-79  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199965 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0047  hypothetical protein  59.83 
 
 
234 aa  280  1e-74  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000487124  normal  0.972099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0971  hypothetical protein  62 
 
 
242 aa  277  9e-74  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3142  hypothetical protein  62.93 
 
 
231 aa  265  5e-70  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1061  hypothetical protein  64.68 
 
 
243 aa  261  4.999999999999999e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354212  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3546  hypothetical protein  76.92 
 
 
131 aa  208  5e-53  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.222814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  31.61 
 
 
255 aa  82  0.000000000000008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  30.86 
 
 
283 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  30.86 
 
 
283 aa  78.6  0.00000000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  31.01 
 
 
275 aa  77.4  0.0000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  30.15 
 
 
293 aa  75.9  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  28.89 
 
 
299 aa  71.6  0.000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  29.84 
 
 
541 aa  69.7  0.00000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  26.28 
 
 
265 aa  63.5  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  30.53 
 
 
1048 aa  51.6  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  32.61 
 
 
413 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  28.12 
 
 
1363 aa  48.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  26.27 
 
 
1373 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  26.09 
 
 
1348 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>