34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BOV_0263 on replicon NC_009505
Organism: Brucella ovis ATCC 25840



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  100 
 
 
275 aa  552  1e-156  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  42.41 
 
 
293 aa  221  8e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  42.42 
 
 
299 aa  210  2e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  52.94 
 
 
283 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  52.94 
 
 
283 aa  155  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  52.24 
 
 
255 aa  151  8.999999999999999e-36  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  52 
 
 
541 aa  140  1.9999999999999998e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0047  hypothetical protein  34.07 
 
 
234 aa  80.5  0.00000000000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000487124  normal  0.972099 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3704  putative lipoprotein  32.28 
 
 
233 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1430  putative lipoprotein  29.94 
 
 
227 aa  77.4  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0020  hypothetical protein  33.57 
 
 
239 aa  77  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199965 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2592  hypothetical protein  45.35 
 
 
436 aa  73.9  0.000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3142  hypothetical protein  27.74 
 
 
231 aa  73.6  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4885  hypothetical protein  45.95 
 
 
205 aa  73.6  0.000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5375  hypothetical protein  30.43 
 
 
233 aa  73.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000248774  hitchhiker  0.0000712008 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2265  hypothetical protein  45.95 
 
 
101 aa  73.2  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.310683  normal  0.0284056 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1061  hypothetical protein  30.15 
 
 
243 aa  70.9  0.00000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354212  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3546  hypothetical protein  30.94 
 
 
131 aa  67  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.222814  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  27.86 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  34.07 
 
 
404 aa  65.1  0.000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0971  hypothetical protein  26.28 
 
 
242 aa  64.7  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  31.91 
 
 
1526 aa  63.2  0.000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  37.78 
 
 
314 aa  59.3  0.00000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  24.62 
 
 
413 aa  56.2  0.0000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  36.56 
 
 
291 aa  54.3  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3474  Toll-interleukin receptor  38.89 
 
 
311 aa  50.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.593743  normal  0.153495 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3804  TIR protein  35 
 
 
374 aa  48.5  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.213149  normal  0.0124229 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  34.83 
 
 
1611 aa  48.1  0.0002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  24.09 
 
 
1656 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  30.3 
 
 
374 aa  45.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  30.93 
 
 
540 aa  42.4  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0934  WD-40 repeat protein  23.53 
 
 
1279 aa  42.4  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  29.47 
 
 
1068 aa  42.4  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0893  pentapeptide repeat-containing protein  29.41 
 
 
357 aa  42.4  0.009  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.417756  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>