23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene YPK_3142 on replicon NC_010465
Organism: Yersinia pseudotuberculosis YPIII



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010465  YPK_3142  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  463  1e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0047  hypothetical protein  62.98 
 
 		 234 aa  287  9e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000487124  normal  0.972099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0971  hypothetical protein  62.55 
 
 		 242 aa  271  5.000000000000001e-72  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.694676 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0020  hypothetical protein  64.85 
 
 		 239 aa  261  6e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.199965 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1430  putative lipoprotein  62.93 
 
 		 227 aa  261  6.999999999999999e-69  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1061  hypothetical protein  59.66 
 
 		 243 aa  245  4.9999999999999997e-64  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.354212  n/a   
 
 
-
 
NC_007950  Bpro_5375  hypothetical protein  68.42 
 
 		 233 aa  239  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000248774  hitchhiker  0.0000712008 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3704  putative lipoprotein  59.57 
 
 		 233 aa  233  2.0000000000000002e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3546  hypothetical protein  67.18 
 
 		 131 aa  181  6e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.222814  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  34.81 
 
 		 255 aa  89  6e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  31.58 
 
 		 293 aa  85.5  6e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  32.59 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  32.59 
 
 		 283 aa  75.9  0.0000000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  30.37 
 
 		 275 aa  73.9  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  29.63 
 
 		 299 aa  71.2  0.00000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  34.13 
 
 		 541 aa  66.6  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0804  TIR protein  27.07 
 
 		 265 aa  66.6  0.0000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.859929  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  32.31 
 
 		 1363 aa  50.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  30.28 
 
 		 413 aa  50.1  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  29.06 
 
 		 1526 aa  43.1  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  24.21 
 
 		 1048 aa  42.7  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  30.3 
 
 		 1656 aa  42  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  28.33 
 
 		 1348 aa  41.6  0.01  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>