14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xaut_4885 on replicon NC_009717
Organism: Xanthobacter autotrophicus Py2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009717  Xaut_4885  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  416  1e-116  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.935392 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2265  hypothetical protein  99.01 
 
 		 101 aa  206  3e-52  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.310683  normal  0.0284056 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1263  TIR protein  64.86 
 
 		 255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0901664  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1472  Toll-interleukin receptor  60 
 
 		 283 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1496  TIR protein  60 
 
 		 283 aa  95.1  6e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.539335  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2310  TIR protein  42.11 
 
 		 293 aa  81.6  0.000000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000000002638 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  46.67 
 
 		 299 aa  77.8  0.0000000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  45.95 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2592  hypothetical protein  40.79 
 
 		 436 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.788234  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2269  hypothetical protein  45.45 
 
 		 541 aa  60.5  0.00000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0213435  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0055  ABC transporter related  28.07 
 
 		 252 aa  45.4  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.880388  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4447  ABC transporter related  28.95 
 
 		 262 aa  45.1  0.0008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3246  ABC transporter related  28.95 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.373982  normal  0.0991744 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8050  ABC transporter related  28.07 
 
 		 261 aa  43.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0251922  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>