69 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2995 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  100 
 
 		 374 aa  748    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  48.21 
 
 		 358 aa  146  7.0000000000000006e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  48.95 
 
 		 235 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  46.98 
 
 		 911 aa  139  7e-32  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  46.31 
 
 		 785 aa  138  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  41.62 
 
 		 266 aa  136  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  49.23 
 
 		 540 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  41.58 
 
 		 705 aa  129  6e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  47.02 
 
 		 385 aa  124  3e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  45.08 
 
 		 388 aa  122  8e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  38.37 
 
 		 1901 aa  120  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  48.7 
 
 		 161 aa  119  9e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  43.31 
 
 		 157 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  46.77 
 
 		 715 aa  114  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  39.89 
 
 		 237 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  40.62 
 
 		 238 aa  114  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  41.91 
 
 		 1355 aa  114  4.0000000000000004e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  46.22 
 
 		 405 aa  113  5e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  46.96 
 
 		 850 aa  112  2.0000000000000002e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  40.21 
 
 		 564 aa  110  3e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  45.03 
 
 		 934 aa  108  2e-22  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  38.61 
 
 		 1068 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  43.55 
 
 		 899 aa  97.1  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  38.61 
 
 		 1056 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  38.12 
 
 		 464 aa  87.4  4e-16  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  37.67 
 
 		 524 aa  86.7  6e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  36.97 
 
 		 859 aa  86.3  8e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  39.13 
 
 		 897 aa  80.9  0.00000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  41.88 
 
 		 963 aa  80.9  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  38.26 
 
 		 992 aa  79.7  0.00000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  38.26 
 
 		 900 aa  77  0.0000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  37.01 
 
 		 829 aa  76.3  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  34.85 
 
 		 268 aa  76.3  0.0000000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  35.94 
 
 		 793 aa  75.1  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  31.4 
 
 		 1309 aa  70.1  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  28.26 
 
 		 367 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  30.53 
 
 		 1348 aa  55.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  34.21 
 
 		 1363 aa  55.1  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5434  TIR protein  32.43 
 
 		 413 aa  54.7  0.000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.363832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6784  TPR repeat-containing protein  30.3 
 
 		 1526 aa  52.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3400  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.42 
 
 		 880 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2703  putative signal transduction protein with Nacht domain  28.42 
 
 		 880 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1783  TIR protein  31.33 
 
 		 316 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0023  hypothetical protein  31.63 
 
 		 320 aa  48.5  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  29.09 
 
 		 1373 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5303  WD-40 repeat protein  30.43 
 
 		 1656 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1258  hypothetical protein  24.38 
 
 		 431 aa  47.4  0.0004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0255884 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0257  hypothetical protein  30 
 
 		 404 aa  47.4  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.32081  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2941  hypothetical protein  31.15 
 
 		 286 aa  47.4  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4630  TIR protein  25 
 
 		 291 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.788158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2378  WD-40 repeat protein  19.79 
 
 		 1016 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2233  protein of unknown function DUF323  26.35 
 
 		 398 aa  46.6  0.0007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00201731  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2429  WD-40 repeat protein  19.79 
 
 		 1016 aa  46.6  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6380  hypothetical protein  32.57 
 
 		 1017 aa  46.6  0.0007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.726246 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0263  hypothetical protein  28.99 
 
 		 275 aa  46.2  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.425608  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4184  sensor protein  30.67 
 
 		 1048 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00072831 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0276  WD-40 repeat-containing protein  29.73 
 
 		 994 aa  45.1  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2479  protein of unknown function DUF323  25.75 
 
 		 398 aa  44.7  0.003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  37.31 
 
 		 1807 aa  44.3  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2742  TIR protein  23.81 
 
 		 320 aa  44.3  0.003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000609469  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0583  hypothetical protein  28.05 
 
 		 552 aa  44.3  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  31.91 
 
 		 1611 aa  44.7  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3012  hypothetical protein  25 
 
 		 314 aa  44.3  0.004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4289  hypothetical protein  28.57 
 
 		 137 aa  44.3  0.004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0113  TIR protein  26.79 
 
 		 299 aa  43.9  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0221539  hitchhiker  0.00922586 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3808  PASTA domain-containing protein  26.42 
 
 		 485 aa  43.5  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.309387 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0254  TIR (Toll-Interleukin 1-resistance) domain containing protein-like protein  26.67 
 
 		 279 aa  43.1  0.007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1507  putative signal transduction protein with Nacht domain protein  25 
 
 		 825 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000204604 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0441  hypothetical protein  28.4 
 
 		 1010 aa  42.7  0.01  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.38406 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>