34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3522 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  539  9.999999999999999e-153  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  35.76 
 
 		 358 aa  104  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  36.05 
 
 		 540 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  34.97 
 
 		 705 aa  100  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  33.18 
 
 		 266 aa  99.4  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  37.8 
 
 		 385 aa  95.1  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  36.97 
 
 		 934 aa  92  1e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  39.84 
 
 		 564 aa  90.1  3e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  38.14 
 
 		 161 aa  88.6  9e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  36.44 
 
 		 405 aa  83.2  0.000000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  34.38 
 
 		 1355 aa  81.3  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  30.94 
 
 		 715 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  34.65 
 
 		 235 aa  76.3  0.0000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  34.85 
 
 		 374 aa  76.3  0.0000000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  34.13 
 
 		 1901 aa  75.1  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  34.43 
 
 		 850 aa  73.6  0.000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  33.62 
 
 		 859 aa  72.8  0.000000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  30.08 
 
 		 785 aa  67.4  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  27.34 
 
 		 388 aa  67.8  0.0000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  30.89 
 
 		 911 aa  67.8  0.0000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  30 
 
 		 157 aa  66.6  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  35.16 
 
 		 829 aa  65.9  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  31.16 
 
 		 899 aa  64.7  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  28.35 
 
 		 1068 aa  63.2  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  33.86 
 
 		 1056 aa  62.4  0.000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  31.3 
 
 		 900 aa  62  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  29.57 
 
 		 992 aa  61.2  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  26.95 
 
 		 238 aa  57  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  29.66 
 
 		 963 aa  57  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  27.83 
 
 		 897 aa  57  0.0000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  29.41 
 
 		 464 aa  56.6  0.0000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  28.23 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  35.34 
 
 		 793 aa  55.8  0.0000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  28.92 
 
 		 1309 aa  43.1  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>