43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_6388 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  100 
 
 		 161 aa  319  9.999999999999999e-87  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  78.17 
 
 		 405 aa  202  2e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  63.92 
 
 		 934 aa  177  5.999999999999999e-44  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1875  TIR protein  63.89 
 
 		 564 aa  160  1e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.399913 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  52.2 
 
 		 358 aa  155  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  52.45 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  56.71 
 
 		 385 aa  147  5e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  48.18 
 
 		 235 aa  142  2e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  52.9 
 
 		 540 aa  140  5e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  50 
 
 		 1355 aa  137  7e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6357  TIR protein  49.66 
 
 		 715 aa  136  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  50 
 
 		 1901 aa  134  8e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  46.53 
 
 		 911 aa  129  1.0000000000000001e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  41.43 
 
 		 388 aa  128  3e-29  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6114  TIR protein  50 
 
 		 237 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  45.14 
 
 		 785 aa  126  1.0000000000000001e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011893  Mnod_8809  TIR protein  50 
 
 		 238 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2995  Toll-interleukin receptor  45.52 
 
 		 374 aa  124  4.0000000000000003e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.462352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  45.07 
 
 		 705 aa  121  4e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3449  tetratricopeptide TPR_4  50.36 
 
 		 1056 aa  121  5e-27  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0502975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  47.65 
 
 		 850 aa  119  1.9999999999999998e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0319  TIR protein  40.71 
 
 		 157 aa  104  4e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3522  hypothetical protein  40.31 
 
 		 268 aa  99  2e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.722717  normal  0.782368 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2455  tetratricopeptide TPR_4  43.92 
 
 		 829 aa  96.3  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0262289  normal  0.779517 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1407  putative ATP/GTP binding protein  42.74 
 
 		 859 aa  89  3e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0320  hypothetical protein  36.67 
 
 		 1068 aa  87  9e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4251  tetratricopeptide TPR_4  36.81 
 
 		 899 aa  82.4  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.553547  normal  0.492439 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1862  NB-ARC domain protein  43.06 
 
 		 897 aa  80.1  0.00000000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3439  hypothetical protein  37.93 
 
 		 464 aa  79  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.492006  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  46.61 
 
 		 963 aa  77  0.0000000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1167  putative ATP/GTP binding protein  38.79 
 
 		 992 aa  73.2  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.944316  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1260  putative ATP/GTP binding protein  39.5 
 
 		 900 aa  72.4  0.000000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.223492  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6887  hypothetical protein  32.93 
 
 		 524 aa  68.9  0.00000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3483  NB-ARC domain protein  47.06 
 
 		 793 aa  54.3  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6333  hypothetical protein  46.15 
 
 		 373 aa  53.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5724  ATP/GTP-binding protein  34.38 
 
 		 1309 aa  52.4  0.000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.308781 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  44.62 
 
 		 1807 aa  48.5  0.00003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1231  hypothetical protein  34.17 
 
 		 570 aa  45.4  0.0003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2375  hypothetical protein  24.09 
 
 		 303 aa  43.5  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  unclonable  0.000173875  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  31.51 
 
 		 1611 aa  42.7  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3638  hypothetical protein  60 
 
 		 47 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1843  SEFIR domain-containing protein  29.23 
 
 		 513 aa  42  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3920  helix-turn-helix, AraC type  24.07 
 
 		 367 aa  41.2  0.007  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.597723 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>