17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_3638 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_3638  hypothetical protein  100 
 
 		 47 aa  93.2  1e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.841293 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1951  tetratricopeptide TPR_4  67.74 
 
 		 358 aa  51.6  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.202218  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1105  TPR repeat-containing protein  58.06 
 
 		 911 aa  49.7  0.00001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2380  TPR repeat-containing protein  58.06 
 
 		 785 aa  49.7  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  64.52 
 
 		 540 aa  48.1  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6388  putative ATP/GTP binding protein  56.41 
 
 		 161 aa  45.8  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.124755 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3441  TPR repeat-containing protein  64.52 
 
 		 850 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0313  hypothetical protein  54.84 
 
 		 388 aa  44.7  0.0005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0876  putative ATP/GTP binding protein  51.02 
 
 		 934 aa  44.7  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.486625 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5337  TIR protein  67.74 
 
 		 385 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.135441 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6780  hypothetical protein  63.33 
 
 		 405 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2317  TIR protein  64.52 
 
 		 266 aa  43.5  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4186  tetratricopeptide TPR_4  61.29 
 
 		 963 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3107  hypothetical protein  55.17 
 
 		 235 aa  42.4  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.408395  normal  0.664388 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1486  hypothetical protein  54.84 
 
 		 705 aa  41.6  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  54.84 
 
 		 1901 aa  41.6  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2751  WD-40 repeat-containing protein  54.84 
 
 		 1355 aa  41.2  0.005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.865283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>